| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 1,590,147 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑146/+703) | ydeT ← / ← hipA | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT/serine/threonine‑protein kinase toxin HipA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1590147 = | 0 (0.000) | 101 (1.130) | 68/598 | 0.1 | 100% | intergenic (‑146/+707) | ydeT/hipA | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT/serine/threonine‑protein kinase toxin HipA |
| ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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ACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATTGTGTCTGCTCATTGGTGTCTCCGGTAGGAGGCTTGACGGTGTAACCACTCATTCGACTGTAGGCACTGTCGGATAAGTTATAAAAACCTTGCGTAGAATAGCGATATCCTGCGACCTGGATATTGGTTCCACAACAAGTTTATTGCTGCACTTGTTGAAGAGAGTATTTGCAAAAACATTTTATGTCGCTAAATAACATGACGATTTCATTATGCATGTTATTTATAAACCGTGACTAAACAGAATATTATTGCGAACAAGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAGGGTTTATTAAAGCTGTCCGACAGACTTTCTTAACCTGGTAATATCTCTCTTGGGTGACTCTCCAAACATCCGCGAATATTCCCGACTGAAATGGGATAGCTTTCGTAACCGACAGCAT > NC_000913/1589852‑1590445 | aCTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTTAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATTGTGTCTGCTCATTGGTGTCTCCGGTAGGAGGCTTGACGGTGTAACCACTCATTCGACTGTAGGCACTGTCGGATAAGTTATAAAAACCTTGCGTAGAATAGCGATATCCTGCGACCTGGATATTGGTTCCACAACAAGTTTATTGCTGCACTTGTTGAAGAGAGTATTTGCAAAAACATTTTATATCGCTAAATAACATGAc < 1:711275/300‑1 (MQ=255) 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ACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACTGTAGAACAGATTAAAATAATCAATAAATTGTGTCTGCTCATTGGTGTCTCCGGTAGGAGGCTTGACGGTGTAACCACTCATTCGACTGTAGGCACTGTCGGATAAGTTATAAAAACCTTGCGTAGAATAGCGATATCCTGCGACCTGGATATTGGTTCCACAACAAGTTTATTGCTGCACTTGTTGAAGAGAGTATTTGCAAAAACATTTTATGTCGCTAAATAACATGACGATTTCATTATGCATGTTATTTATAAACCGTGACTAAACAGAATATTATTGCGAACAAGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAGGGTTTATTAAAGCTGTCCGACAGACTTTCTTAACCTGGTAATATCTCTCTTGGGTGACTCTCCAAACATCCGCGAATATTCCCGACTGAAATGGGATAGCTTTCGTAACCGACAGCAT > NC_000913/1589852‑1590445 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |