| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,301,713 | IS30 (–) +2 bp | coding (532‑533/1632 nt) | oppA → | oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1301714 | 0 (0.000) | 101 (1.140) | 74/596 | 0.1 | 100% | coding (533/1632 nt) | oppA | oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GTCATCCAGCACCTGGCGTCGCTGAATCCTGGGATAATAAAGACGCGAAAGTCTGGACCTTCCATTTGCGTAAAGATGCGAAATGGTCTGATGGCACGCCAGTCACAGCACAAGACTTTGTGTATAGCTGGCAACGTTCTGTTGATCCGAACACTGCTTCTCCGTATGCCAGTTATCTGCAATATGGGCATATCGCCGGTATTGATGAAATTCTTGAAGGGAAAAAACCGATTACCGATCTCGGCGTGAAAGCTATTGATGATCACACATTAGAAGTCACCTTAAGTGAACCCGTTCCGTACTTCTATAAATTACTTGTTCACCCATCAACTTCACCGGTGCCAAAAGCCGCTATCGAGAAATTCGGCGAAAAATGGACCCAGCCTGGTAATATCGTCACCAACGGTGCCTATACCTTAAAAGATTGGGTCGTAAACGAACGAATCGTTCTTGAACGCAGCCCGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGAAGTTACCGATGTCAACCGCTACCGTAGTGGTGAAATCGACATGACGAATAACAGCATGCCGATCGAA > NC_000913/1301420‑1302012 | tgctcattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGTTCCGTAc > 1:46614‑M1/292‑300 (MQ=255) cATCCAGCACCTTGCGTCGCTGAATCCTGGGATAATAAAGACGCGAAAGTCTGGACCTTCCATTTGCGTAAAGATGCGAAATGGTCTGATGGCACGCCAGTCACANCACAAGACTTTGTGTATAGCTGGCAACGTTCTGTTGATCCGAACACTGCTTCTCCGTATGCCAGTTATCTGCAATATGGGCATATCGCCGGTATTGATGAAATTCTTGAAGGGAAAAAACCGATTACCGATCTCGGCGTGAAAGCTATTGATGATCACACATTAGAAGTCACCTTAAGTGAACCCGTtgtagat < 2:618680‑M1/300‑8 (MQ=255) cATCCAGCACCTGTCGTCGCTGAATCCTGGGATAATAAAGACGCGAAAGTCTGTACCTTCCATTTGCGTAAAGATGCGAAATGGTCTGATTGCACGCCAGTCACAGCACAAGACTTTGTGTATAGCTGGCAANGTTCTGTTGATCCGAACACTGCTTCTCCGTATGCCAGTTATCTGCAATATGGGCATAGCGCCGGTATTGATGAAATTCTTGAAGGGAAAAAACCGACTACCGATCTCGGCGTGAAAGCTATTGATGATCACACATTAGAAGTCACCTTAAGTGAACCCGTtgtagat < 2:161275‑M1/300‑8 (MQ=255) cATCCAGCACCTGGCGTCGCTGAATCCTGGGATAATAAAGACGCGAAAGTCTGGACCTTCCATTTGCGTAAAGATGCGAAATGGTCTGATGGCACGCCAGTCACAGCACAAGACTTTGTGTATAGCTGGCAACGTTCTGTTGATCCGAACACTGCTTCTCCGTATGCCAGTTATCTGCAATATGGGCATATCGCCGGTATTGATGAAATTCTTGAAGGGAAAAAACCGATTACCGATCTCGGCGTGAAAGCTATTGATGATCACACATTAGAAGTCACCTTAAGTGAACCCGTtgtagat > 1:674994‑M1/1‑293 (MQ=255) 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ccTTAAGTGAACCCGTtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcaaccagatctagttcatgttgagtatattgggcaagacatgtctttttagaaaagtactgccgaattagcccatttgtgttctcatttgttccccgttgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtatggccagtttcattcctatgtcc > 2:56761‑M1/1‑16 (MQ=255) aattgaatctacaGTTCCGTACTTCTATAAATTACTTGTTCACCCATCAACTTCACCGGTGCCAAAAGCCGCTATCGAGAAATTCGGCGAAAAATGGACCCAGCCTGGTAATATCGTCACCAACGGTGCCTATACCTTAAAAGATTGGGTCGTAAACGAACGAATCGTTCTTGAACGCAGCCCGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGAAGTTACCGATGTCAACCGCTACCGTAGTGGTGAAATCGACATGACGTATAACAg > 2:368573‑M1/14‑300 (MQ=255) aattgaatctacaGTTCCGTACTTCTATAAATTACTTGTTCACCCATCAACTTCACCGGTGCCAAAAGCCGCTATCGAGAAATTCGGCGAAAAATGGACCCAGCCTGGTAATATCGTCACCAACGGTGCCTATACCTTAAAAGATTGGGTCGTAAACGAACGAATCGTTCTTGAACGCAGCCCGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGAAGTTACCGATGTCAACCGCTACCGTAGTGGTGAAATCGACATGACGTATAACAg > 1:44392‑M1/14‑300 (MQ=255) aGTGAACCCGTtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcanccagatctagttcatgttgagtatattgggcaagacatgtctttttaggaaagtactgccgaattagcccatttgtgttctcatttgttccccgctgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtctggccagttccattcctctgtcccatgt < 1:498893‑M1/300‑290 (MQ=255) aGTGAACCCGTtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcaaccagatctagttcatgttgagtatattgggcaagacatntctttttaggaaagtactgccgaattngcccatttgtgttctcatttgttccccgctgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtctggccagttccattcctctgtcccatgt < 2:475382‑M1/300‑290 (MQ=255) gTGAACCCGTtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcaaccagatctagttcatgttgagtatattgggcaagacatgtctttttaggaaagtactgccgaattagcccatttgtgttctcatttgttccccgctgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtctggccagttccattcctctgtcccatgtc < 1:152332‑M1/300‑291 (MQ=255) 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GTCATCCAGCACCTGGCGTCGCTGAATCCTGGGATAATAAAGACGCGAAAGTCTGGACCTTCCATTTGCGTAAAGATGCGAAATGGTCTGATGGCACGCCAGTCACAGCACAAGACTTTGTGTATAGCTGGCAACGTTCTGTTGATCCGAACACTGCTTCTCCGTATGCCAGTTATCTGCAATATGGGCATATCGCCGGTATTGATGAAATTCTTGAAGGGAAAAAACCGATTACCGATCTCGGCGTGAAAGCTATTGATGATCACACATTAGAAGTCACCTTAAGTGAACCCGTTCCGTACTTCTATAAATTACTTGTTCACCCATCAACTTCACCGGTGCCAAAAGCCGCTATCGAGAAATTCGGCGAAAAATGGACCCAGCCTGGTAATATCGTCACCAACGGTGCCTATACCTTAAAAGATTGGGTCGTAAACGAACGAATCGTTCTTGAACGCAGCCCGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGAAGTTACCGATGTCAACCGCTACCGTAGTGGTGAAATCGACATGACGAATAACAGCATGCCGATCGAA > NC_000913/1301420‑1302012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |