Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,145,135 | IS3 (+) +3 bp | coding (196‑198/960 nt) | rluC → | 23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 1094245 = | NA (NA) | 68 (0.760) | 47/598 | 0.6 | 100% | noncoding (1258/1258 nt) | IS3 | repeat region |
? | NC_000913 | 1145135 = | 0 (0.000) | coding (196/960 nt) | rluC | 23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1095502 | NA (NA) | 76 (0.850) | 59/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1258 nt) | IS3 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1145137 | 0 (0.000) | coding (198/960 nt) | rluC | 23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase |
CAGCTGGCGTTTGAGACGTGCAATCTCGGTAGACATCTCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1095207‑1095502 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CACCTCATCACCCGCTTCGAGTTTATATTCAGGCTTAATACGTTTTTTGTTCACCCGCACTTCGCCTTTACGCAAAATACGGTAAATCATACTTTTTGGTACGCCTTTCAATTGGGTACGCAAAAAGTTATCGATACGTTGCCCCGCTTCGTCAGCGGTGATAGCAACAATTTTTACGGATGGAGTCTCTGTTTTCATGGTTGGCGATTCTAATTAGCCAACAGGATTCGCGCCACTCATTTTTCTATGCTTATATTTACTTTTGCACCTTATTACTTCACTGCGTGATCACTTTATTG < NC_000913/1145137‑1144839 CAGCTGGCGTTTGAGACGTGCAATCTCGGTAGACATCTCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCACACC < 1:592417/300‑1 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CACTATTGCTGGGTAAGATCACACCTCATCACCCGCTTCGAGTTTATATTCAGGCTTAATACGTTTTTTGTTCACCCGCACTTCGCCTTTACGCAAAATACGGTAAATCATACTTTTTGGTACGCCTTTCAATTGGGTACGCAAAAAGTTATCGATACGTTGCCCCGCTTCGTCAGCGGTGATAGCAACAATTTTTACGGATGGAGTCTCTGTTTTCATGGTTGGCGATTCTAATTAGCCAACAGGATTCGCGCCACTCATTTTTCTATGCTTATATTTACTTTTGCACCTTATTACTTC < 1:564774/300‑1 CTATTGCTGGGTAAGATCACACCTCATCACCCGCTTCGAGTTTATATTCAGGCTTAATACGTTTTTTGTTCACCCGCACTTCGCCTTTACGCAAAATACGGTAAATCATACTTTTTGGTACGCCTTTCAATTGGGTACGCAAAAAGTTATCGATACGTTGCCCCGCTTCGTCAGCGGTGATAGCAACAATTTTTACGGATGGAGTCTCTGTTTTCATGGTTGGCGATTCTAATTAGCCAACAGGATTCGCGCCACTCATTTTTCTATGCTTATATTTACTTTTGCACCTTATTACTTCAC < 1:582746/300‑1 GGGTAAGATCACACCTCATCACCCGCTTCGAGTTTATATTCAGGCTTAATACGTTTTTTGTTCACCCGCACTTCGCCTTTACGCAAAATACGGTAAATCATACTTTTTGGTACGCCTTTCAATTGGGTACGCAAAAAGTTATCGATACGTTGCCCCGCTTCGTCAGCGGTGATAGCAACAATTTTTACGGATGGAGTCTCTGTTTTCATGGTTGGCGATTCTAATTAGCCAACAGGATTCGCGCCACTCATTTTTCTATGCTTATATTTACTTTTGCACCTTATTACTTCACTGCGTGAT > 1:304268/1‑300 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CAGCTGGCGTTTGAGACGTGCAATCTCGGTAGACATCTCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1095207‑1095502 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CACCTCATCACCCGCTTCGAGTTTATATTCAGGCTTAATACGTTTTTTGTTCACCCGCACTTCGCCTTTACGCAAAATACGGTAAATCATACTTTTTGGTACGCCTTTCAATTGGGTACGCAAAAAGTTATCGATACGTTGCCCCGCTTCGTCAGCGGTGATAGCAACAATTTTTACGGATGGAGTCTCTGTTTTCATGGTTGGCGATTCTAATTAGCCAACAGGATTCGCGCCACTCATTTTTCTATGCTTATATTTACTTTTGCACCTTATTACTTCACTGCGTGATCACTTTATTG < NC_000913/1145137‑1144839 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |