| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,164,123 | C→G | A162G (GCA→GGA) | btuB → | cobalamin outer membrane transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,164,123 | 0 | C | G | 99.1% | 401.6 / NA | 108 | A162G (GCA→GGA) | btuB | cobalamin outer membrane transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (59/48); minor base T (0/1); total (59/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GTGCTGCGCCGTCTTCCGGGCGTCGATATCACCCAAAACGGCGGTTCAGGTCAGCTCTCATCTATTTTTATTCGCGGTACAAATGCCAGTCATGTGTTGGTGTTAATTGATGGCGTACGCCTGAATCTGGCGGGGGTGAGTGGTTCTGCCGACCTTAGCCAGTTCCCTATTGCGCTTGTCCAGCGTGTTGAATATATCCGTGGGCCGCGCTCCGCTGTTTATGGTTCCGATGCAATAGGCGGGGTGGTGAATATCATCACGACGCGCGATGAACCCGGAACGGAAATTTCAGCAGGGTGGGGAAGCAATAGTTATCAGAACTATGATGTCTCTACGCAGCAACAACTGGGGGATAAGACACGGGTAACGCTGTTGGGCGATTATGCCCATACTCATGGTTATGATGTTGTTGCCTATGGTAATACCGGAACGCAAGCGCAGACAGATAACGATGGTTTTTTAAGTAAAACGCTTTATGGCGCGCTGGAGCATAACTTTACTGATGCCTGGAGCGGCTTTGTGCGCGGCTATGGCTATGATAACCGTACCAATTATGACGCGTATTATTCTCCCGGTTCACCGTTGCTC > NC_000913/4163831‑4164418 | gtgCTGCGCCGTCTTCCGGGCGTCGATATCACCCAAAACGGCGGTTCAGGTCAGCTCTCATCTATTTTTATTCGCGGTACAAATGCCAGTCATGTGTTGGTGTTAATTGATGGCGTACGCCTGAATCTGGCGGGGGTGAGTGGTTCTGCCGACCTTAGCCAGTTCCCTATTGCGCTTGTCCAGCGTGTTGAATATATCCGTGGGCCGCGCTCCGCTGTTTATGGTTCCGATGCAATAGGCGGGGTGGTGAATATCATCACGACGCGCGATGAACCCGGAACGGAAATTTCAGGAGGGTgg > 1:65324/1‑300 (MQ=255) 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tGAACCCTGAACGTAAATTTCATGAGGGTGGGGAAGCAATAGTTATCAGAACTATGATGTCTCCACGCAGCAACAACTGGGGGATAAGACACGGGTAACGCTGTTGGGCGATTCTGCCCATACTCATGGTTATGATGTTGTTGCCTATGGTAATACCGGAACGCAAGCGCAGACAGATAACGATAGTTTTTTAAGTAAAACGCTTTATGGCGCGCTGGAGCATAACTTTACTGATGCCTAGAGCGGCTTTGTGCGCGGCTATGGCTATGATAACCGTACCAATTATGACGCCTATTATtc < 2:262519/300‑1 (MQ=255) tGAACCCGGAACGGAAATTTCAGGAGGGTGTGGAAGCAATAGTTATCAGAACTATGATGTCTCTACGCAGCAACAACTGGGGGATAAGACACGGGTAACGCTGTTGGGCGATTATGCCCATACTCATGGTTATGATGTTGTTGCCTATGGTAATACCGGAACGCAAGCGCAGACAGATAACGATGGTTTTTTAAGTAAAACGCTTTATGGCGCGCTGGAGCATAACTTTACTGATGCCTAGAGCGGCTTTGTGCGCGGCTATGGCTATGATAACCGTACCAATTATGACGCGTATTATtc < 1:395113/300‑1 (MQ=255) tGAACCCGGAACGGAAATTTCAGGAGGGTGGGGAAGCAATAGTTATCAGAACTATGATGTCTCTACGCAGCAACAACTGGGGGATAAGACACGGGTAACGCTGTTGGGCGATTATGCCCATACTCATGGTTATGATGTTGTTGCCTATGGTAATACCGGAACGCAAGCGCAGACAGATAACGATGGTTTTTTAAGTAAAACGCTTTATGGCGCGCTGGAGCATAACTTTACTGATGCCTAGAGCGGCTTTGTGCGCGGCTATGGCTATGATAACCGTACCAATTATGACGCGTATTATtc < 1:29824/300‑1 (MQ=255) tGAACCCGGAACGGAAACTTCAGGAGGGTGGGGAAGCAATAGTTATCAGAACTATGATGTCTCTACGCAGCAACAACTGGGGGATAAGACACGGGTAACGCTGTTGGGCGATTATGCCCATACTCATGGTTATGATGTTGTTGCCTATGGTAATACCGGAACGCAAGCGCAGACAGATAACGATGGTTTTTTAAGTAAAACGCTTTATGGCGCGCTGGAGCATAACTTTACTGATGCCTAGAGCGGCTTTGTGCGCGGCTATGGCTATGATAACCGTACCAATTATGACGCGTATTATtc < 2:291757/300‑1 (MQ=255) aaaTTTCAGGAGGGTGGGGAAGCAATAGTTATCAGAACTATGATGTCTCTACGCAGCAACAACTGGGGGATAAGACACGGGTAACGCTGTTGGGCGATTATGCCCATACTCATGGTTATGATGTTGTTGCCTATGGTAATACCGGAACGCAAGCGCAGACAGATAACGATGGTTTTTTAAGTAAAACGCTTTATGGCGCGCTGGAGCATAACTTTACTGATGCCTAGAGCGGCTTTGTGCGCGGCTATGGCTATGATAACCGTACCAATTATGACGCGTATTATTCTCCCGGTTCACCGt < 1:455397/300‑1 (MQ=255) tCAGGAGGGTGGGGAAGCAATAGTTATCAGAACTATGATGTCTCTACGCAGCAANAACTGGGGGATAAGACACGGGTAACGCTGTTGGGCGATTATGCCCATACTCATGGTTATGATGTTGTTGCCTATGGTAATACCGGAACGCAAGCGCAGACAGATAACGATGGTTTTTTAAGTAAAACGCTTTATGGCGCGCTGGAGCATAACTTTACTGATGCCTAGAGCGGCTTTGTGCGCGGCTATGGCTATGATAACCGTACCAATTATGACGCGTATTATTCTCCCGGTTCACCGTTGCTc < 2:606496/300‑1 (MQ=255) | GTGCTGCGCCGTCTTCCGGGCGTCGATATCACCCAAAACGGCGGTTCAGGTCAGCTCTCATCTATTTTTATTCGCGGTACAAATGCCAGTCATGTGTTGGTGTTAATTGATGGCGTACGCCTGAATCTGGCGGGGGTGAGTGGTTCTGCCGACCTTAGCCAGTTCCCTATTGCGCTTGTCCAGCGTGTTGAATATATCCGTGGGCCGCGCTCCGCTGTTTATGGTTCCGATGCAATAGGCGGGGTGGTGAATATCATCACGACGCGCGATGAACCCGGAACGGAAATTTCAGCAGGGTGGGGAAGCAATAGTTATCAGAACTATGATGTCTCTACGCAGCAACAACTGGGGGATAAGACACGGGTAACGCTGTTGGGCGATTATGCCCATACTCATGGTTATGATGTTGTTGCCTATGGTAATACCGGAACGCAAGCGCAGACAGATAACGATGGTTTTTTAAGTAAAACGCTTTATGGCGCGCTGGAGCATAACTTTACTGATGCCTGGAGCGGCTTTGTGCGCGGCTATGGCTATGATAACCGTACCAATTATGACGCGTATTATTCTCCCGGTTCACCGTTGCTC > NC_000913/4163831‑4164418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |