| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 4,542,448 | IS5 (–) +4 bp | coding (412‑415/597 nt) | fimE → | regulator for fimA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3652036 = | NA (NA) | 116 (1.130) | 78/594 | 0.1 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4542451 | 0 (0.000) | coding (415/597 nt) | fimE | regulator for fimA | |||||
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GGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGGACCTTGACCTTAATGAAGGTAGAATAAATATTCGCCGACTGAAGAACGGATTTTCTACCGTTCACCCGTTACGTTTTGATGAGCGTGAAGCCGTGGAACGCTGGACCCAGGAACGTGCTAACTGGAAAGGCGCTGACCGGACTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAA > NC_000913/4542152‑4542746 | gccatcgctcaggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAAGGc < 1:812029‑M2/7‑1 (MQ=255) 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GGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGGACCTTGACCTTAATGAAGGTAGAATAAATATTCGCCGACTGAAGAACGGATTTTCTACCGTTCACCCGTTACGTTTTGATGAGCGTGAAGCCGTGGAACGCTGGACCCAGGAACGTGCTAACTGGAAAGGCGCTGACCGGACTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAA > NC_000913/4542152‑4542746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |