| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 736,715 | C→T | intergenic (+16/‑1377) | ybfQ → / → ybfD | inactive transposase YbfQ/H repeat‑associated putative transposase YbfD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 736,715 | 0 | C | T | 97.0% | 315.1 / NA | 102 | intergenic (+16/‑1377) | ybfQ/ybfD | inactive transposase YbfQ/H repeat‑associated putative transposase YbfD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base T (58/39); total (60/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATTCCCGATTACAGATAAGCCTGGAAAGTAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCA > NC_000913/736420‑737003 | cTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTCTCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTATTaaa > 1:469445/1‑300 (MQ=255) 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cTACTTTTTTGTATTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATTCCCGATTACAGATAAGCCTGGAAAGTAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAg > 2:578767/1‑300 (MQ=255) cTACTTTTTTGTATTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATTCCCGATTACAGATAAGCCTGGAAAGTAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAg > 1:139848/1‑300 (MQ=255) aCTTTTTTGTATTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATTCCCGATTACAGATAAGCCTGGAAAGTAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCa > 1:195607/1‑300 (MQ=255) | CTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATTCCCGATTACAGATAAGCCTGGAAAGTAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCA > NC_000913/736420‑737003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |