| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 209,056 | C→T | L146L (CTG→TTG) | accA → | acetyl‑CoA carboxyltransferase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 209,056 | 0 | C | T | 98.6% | 223.8 / NA | 69 | L146L (CTG→TTG) | accA | acetyl‑CoA carboxyltransferase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (28/40); minor base G (0/1); total (28/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GACACGTAAAATCTTCGCCGATCTCGGTGCATGGCAGATTGCGCAACTGGCACGCCATCCACAGCGTCCTTATACCCTGGATTACGTTCGCCTGGCATTTGATGAATTTGACGAACTGGCTGGCGACCGCGCGTATGCAGACGATAAAGCTATCGTCGGTGGTATCGCCCGTCTCGATGGTCGTCCGGTGATGATCATTGGTCATCAAAAAGGTCGTGAAACCAAAGAAAAAATTCGCCGTAACTTTGGTATGCCAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAGGTTGTGCGTCCATTCTGTGGAAGAGCGCCGAC > NC_000913/208770‑209346 | gACACGTAAAATCTTCGCCGATCTCGGTGCATGGCAGATTGCGCAACTGGCACGCCATCCACAGCGTCCTTATACCCTGGATTACGTTCGCCTGGCATTTGATGAATTTNACGAACTGGCTGGCGACCGCGCGTATGCAGACGATAAAGCTATCGTCGGTGGTATCGCCCGTCTCGATGGTCGTCCGGTGATGATCATTGGTCATCAAAAAGGTCGTGAAACCAAAGAAAAAATTCGCCGTAACTTTGGTATGCCAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTTTGATGCAAATGGc < 1:482063/300‑1 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tctcGGTGCATGGCAGATTGCGCAACTGGCACGCCATCCACAGCGTCCTTATACCCTGGATTACGTTCGCCTGGCATTTGATGAATTTGACGAACTGGCTGGCGACCGCGCGTATGCAGACGATAAAGCTATCGTCGGTGGTATCGCCCGTCTCGATGGTCGTCCGGTGATGATCATTGGTCATCAAAAAGGTCGTGAAACCAAAGAAAAAATTCGCCGTAACTTTGGTATGCCAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTTTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTat > 1:568509/1‑300 (MQ=255) aaaTTGCGCAATTGACACGCTATCCACGGCTTCCTTCTACCCTGGATTACGTTCTCCTTGCATTTGATGAATTTGACGAACTGGATGGCGACCGCGCGTAGGCAGACGATAAATCTATCGTCGGTGGTATCGCCCGTCTCGATGGTCGTCCGGTGATGATCATTGGTCATCAAAAAGGTCGTGAAACCAAAGAAAAAATTCGCCGTAACTTTGGTATGCCAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCATTGCGTTTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCg < 2:362064/298‑1 (MQ=255) ttGCGCAACTGGCACGCCATCCACAGCGTCCTTATACCCTGGATTACGTTCGCCTGGCATTTGATGAATTTGACGAACTGGCTGGCGACCGCGCGTATGCAGACGATAAAGCTATCGTCGGTGGTATCGCCCGTCTCGATGGTCGTCCGGTGATGATCATTGGTCATCAAAAAGGTCGTGAAACCAAAGAAAAAATTCGCCGTAACTTTGGTATGCCAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTTTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGaca > 1:334162/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |