| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,634,570 | 0 | G | A | 98.4% | 642.8 / NA | 188 | intergenic (‑1980/‑271) | yhiJ/yhiM | DUF4049 domain‑containing protein YhiJ/inner membrane protein YhiM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (87/98); minor base C (2/1); total (89/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
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gCTGATTTTAAACACCGAGACTATCCGGTCTTTTACCAAATAATGAAGAATAATCCCTCCCTGGAAGATAATTGTAAAAAACAACAGCATAAGAATTAATCTTAGGATAAATTTTTATTTATCATGGCCTTTTGAACGCTGAAAAGTAGCGCTCTGCAAAGTAAACCCCGCTATAGTTATGCTATGCATTTGTCTTTAATGATATCTCGTCATTATATTAACAGGATGAAATTATCATTAATGCATATTTCAATATTAGCAGGGATACCTGAGGAGTTTAAAGTGAACATATATATCggg < 1:5690/300‑1 (MQ=255) cTGATTTTAAACACCGAGACTATCCGGTCTTTTACCAAATAATGAAGAATAATCCCTCCCTGGAAGATAATTGTAAAAAACAACAGCATAAGAATTAATCTTAGGATAAATTTTTATTTATCATGGCCTTTTGAACGCTGAAAAGTAGCGCTCTGCAAAGTAAACCCCGCTATAGTTATGCTATGCATTTGTCTTTAATGATATCTCGTCATTATATTAACAGGATGAAATTATCATTAATGCATATTTCAATATTAGCAGGGATACCTGAGGAGTTTAAAGTGAACATATATATCGGGt < 2:426217/300‑1 (MQ=255) aTTTTAAACACCGAGACTATCCGGTCTTTTACCAAATAATGAAGAATAATCCCTACCTGGAAGATAATTGTAAAAAACAACAGCATAAGAATTAATCTTAGGATAAATTTTTATTTATCATGGCCTTTTGAACGCTGAAAAGTAGCGCTCTGCAAAGTAAACCCCGCTATAGTTATGCTATGCATTTGTCTTTAATGATATCTCGTCATTATATTAACAGGATGAAATTATCATTAATGCATATTTCAATATTAGCAGGGATACCTGAGGAGTTTAAAGTGAACATATATATCGGGTGGc > 1:264688/1‑300 (MQ=255) | TAGATGATATGCAGGCCAAAATCGTTATCTATTTGCGAATCATTATCCAGTTTATCAAATTCAACTATCTTTGCACGATGTGTTTTATCAACCTTGCCATGGTGTTGATGACTGTTAACTTTATCTGAATGCTTATCTTGATGGCTTGAAGAGATGTTTCTAATCTGATTGTCAATTGCTTTCATAAATAACCTGTGATATTTTTGAATTGTTTGTAACAAAATAAATGATACTTGTCTGAAAAACAGATTTACGACGATATAAAATAATAATACTTATATGTTCGCTGATTTTAAGCACCGAGACTATCCGGTCTTTTACCAAATAATGAAGAATAATCCCTCCCTGGAAGATAATTGTAAAAAACAACAGCATAAGAATTAATCTTAGGATAAATTTTTATTTATCATGGCCTTTTGAACGCTGAAAAGTAGCGCTCTGCAAAGTAAACCCCGCTATAGTTATGCTATGCATTTGTCTTTAATGATATCTCGTCATTATATTAACAGGATGAAATTATCATTAATGCATATTTCAATATTAGCAGGGATACCTGAGGAGTTTAAAGTGAACATATATATCGGGTGGC > NC_000913/3634274‑3634862 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |