| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,605,956 | C→T | T69I (ACC→ATC) | yhhN → | PF07947 family protein YhhN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,605,956 | 0 | C | T | 98.9% | 303.9 / NA | 89 | T69I (ACC→ATC) | yhhN | PF07947 family protein YhhN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (31/57); total (32/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |