| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,322,917 | G→A | P385L (CCA→CTA) | glmM ← | phosphoglucosamine mutase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,322,917 | 0 | G | A | 99.1% | 371.3 / NA | 107 | P385L (CCA→CTA) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (40/65); total (41/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TCGCATTGTATCAACTGCGGAAAAAAACAGCAAAACCGATGTGTTCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCATTTTTTCCAGTACGTAGCGGTCACCCACTTTCGCGCGCGCAAATGGAATTCCTAACTGTTTCAGCGCCAGTTCAAGCCCCATGT > NC_000913/3322636‑3323211 | tCGCATTGTATCAACTGCGGAAAAAAACAGCAAAACCGATGTGTTCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTAGATCGCCGCTACCTGCgg < 2:203407/300‑1 (MQ=255) 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TCGCATTGTATCAACTGCGGAAAAAAACAGCAAAACCGATGTGTTCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCGTCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCATTTTTTCCAGTACGTAGCGGTCACCCACTTTCGCGCGCGCAAATGGAATTCCTAACTGTTTCAGCGCCAGTTCAAGCCCCATGT > NC_000913/3322636‑3323211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |