| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,295,957 | G→A | G50E (GGA→GAA) | diaA → | DnaA initiator‑associating protein DiaA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,295,957 | 0 | G | A | 99.1% | 354.0 / NA | 106 | G50E (GGA→GAA) | diaA | DnaA initiator‑associating protein DiaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (56/49); total (57/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGATTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCTGCCAATGCACAGCATTTTGCTGCCAGCATGATCAACCGTTTCGAAACGGAGCGGCCCAGCTTACCTGCCATTGCACTAAATACTGATAATGTTGTCTTAACGGCGATTGCCAACGATCGCTTACATGATGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATTTCCACCCGTGGCAACAGCCGCGATATTGTTAAAGCAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGC > NC_000913/3295663‑3296249 | gACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGATTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGAAACtt > 1:316751/1‑300 (MQ=255) 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ctGTTGTGGTAATGAAACTTCCGCTGCCAATGCACAGCATTTTGCTGCCAGCATGATCAACCGTTTCGAAACGGAGCGGCCCAGCTTACCTGCCATTGCACTAAATACTGATAATGTTGTCTTAACGGAGATTGCCAACGATCGCTTACATGATGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATTTCCACCCGTGGCAACAGCCGCGATATTGTTAAAGCAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTa < 1:457574/300‑1 (MQ=255) tgtgGTAATGAAACTTCCGCTGCCAATGCACAGCATTTTGCTGCCAGCATGATCAACCGTTTCGAAACGGAGCGGCCCAGCTTACCTGCCATTGCACTAAATACTGATAATGTTGTCTTAACGGCGATTGCCAACGATCGCTTACATGATGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGNGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATTTCCACCCGTGGCAACAGCCGCGATATTGTTAAAGCAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGNTATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGAc < 2:491604/300‑1 (MQ=255) tgtgGTAATGAAACTTCCGCTGCCAATGCACAGCATTTTGCTGCCAGCATGATCAACCGTTTCGAAACGGAGCGGCCCAGCTTACCTGCCATTGCACTAAATACTGATAATGTTGTCTTAACGGCGATTGCCAACGATCGCTTACATGATGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATTTCCACCCGTGGCAACAGCCGCGATATTGTTAAAGCAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGAc < 2:656690/300‑1 (MQ=255) tgGTAATGAAACTTCCGCTGCCAATGCACAGCATTTTGCTGCCAGCATGATCAACCGTTTCGAAACGGAGCGGCCCAGCTTACCTGCCATTGCACTAAATACTGATAATGTTGTCTTAACGGCGATTGCCAACGATCGCTTACATGATGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATTTCCACCCGTGGCAACAGCCGCGATATTGTTAAAGCAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGAcgg < 1:261977/300‑1 (MQ=255) ggTAATGAAACTTCCGCTGCCAATGCACAGCATTTTGCTGCCAGCATGATTAACCGTTTCGAAACGGAGCGGCCCAGCTTACCTGCCATTGCACTAAATACTGATAATGTTGTCTTAACGGCGATTGCCAACGATCGCTTACATGATGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATTTCCACCCGTGGCAACAGCCGCGATATTGTTAAAGCAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTTTTGCATTGACCGGCTATGAcggc < 1:311039/300‑1 (MQ=255) ggTAATGAAACTTCCGCTGCCAATGCACAGCATTTTGCTGCCAGCATGATCAACCGTTTCGAAACGGAGCGGCCCAGCTTACCTGCCATTGCACTAAATACTGATAATGTTGTCTTAACGGCGATTGCCAACGATCGCTTACATGATGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATTTCCACCCGTGGCAACAGCCGCGATATTGTTAAAGCAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGAcggc < 1:311030/300‑1 (MQ=255) | GACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGATTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCTGCCAATGCACAGCATTTTGCTGCCAGCATGATCAACCGTTTCGAAACGGAGCGGCCCAGCTTACCTGCCATTGCACTAAATACTGATAATGTTGTCTTAACGGCGATTGCCAACGATCGCTTACATGATGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATTTCCACCCGTGGCAACAGCCGCGATATTGTTAAAGCAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGC > NC_000913/3295663‑3296249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |