| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,021,725 | G→A | G137D (GGC→GAC) | xdhD → | fused putative xanthine/hypoxanthine oxidase: molybdopterin‑binding subunit and Fe‑S binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,021,725 | 0 | G | A | 98.9% | 311.6 / ‑7.0 | 92 | G137D (GGC→GAC) | xdhD | fused putative xanthine/hypoxanthine oxidase: molybdopterin‑binding subunit and Fe‑S binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (44/47); minor base C (1/0); total (45/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
GGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTACCCGCGAAGAGATCGACGACGCGCTTTCTGGTTTGTTCAGCCGCGATGCTGGCTGGCAGCAATACTATCAGGTCATTGAACTGGCGGTTGCACGTAAAAATAATCCGCAGGC‑CACCATTGATATCGCTCCGACTTTCCGTGACGACCTAGAAGTCATTGGTAAGCATTATCCTAAAACTGATGCCGCGAAAATGGTGCAGGCGAAACCCTGCTATGTTGAAGACCGCGTAACGGCTGACGCCTGCGTCATTAAAATGTTACGTAGCCCACACGCTCACGCACTGATTACTCATCTGGATGTCAGCAAAGCTGAAGCCTTACCGGGCGTCGTTCACGTTATTACTC > NC_000913/3021439‑3022018 | gggTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTACCCGCGAAGAGATCGACGACGCGCTTTCTGGTTTGTTCAGCCGCGATGCTGACTGGCAGCAATAc < 1:560788/300‑1 (MQ=255)gggTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTACCCGCGAAGAGATCGACGACGCGCTTTCTGGTTTGTTCAGCCGCGATGCTGACTGGCAGCAATAc < 2:147545/300‑1 (MQ=255) gTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTACCCGCGAAGAGATCGACGACGCGCTTTCTGGTTTGTTCAGCCGCGATGCTGACTGGCAGCAATACTa < 1:534700/300‑1 (MQ=255) ttGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCNTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTACCCGCGAAGAGANCGACGACGCGCTTTCTGGTTTGTTCAGCCGCGATGCTGACTGGCAGCAATACTagc < 2:646924/300‑3 (MQ=255) ccGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTACCCGCGAAGAGATCGACGACGCGCTTTCTGGTTTGTTCAGCCGCGATGCTGACTGGCAGCAATACTATCAgg < 1:444051/300‑1 (MQ=255) cGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTAGTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTACCCGCGAAGAGATCGACGACGCGCTTTCTGGTTTGTTCAGCCGCGATGCTGACTGGCAGCAATACTATCAGGt < 2:123287/300‑1 (MQ=255) aCGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCAACAGGCAATGGTTGATGTTGGCGTGGTGCAGTCTGGTTATAACGATCCAGCTGCAGCTCTGATTATCACCGATCTTCTCGATCGCATCGCCGCACCTACCCGCGAAGAGATCGACGACGCGCTTTCTGGTTTGTTCAGCCGCGATGCTGACTGGCAGCAATACTATCAGGTCATTGAAc < 1:190738/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |