| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,042,111 | C→T | intergenic (+86/‑257) | zinT → / → yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome b561 YodB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,042,111 | 0 | C | T | 98.9% | 317.2 / NA | 93 | intergenic (+86/‑257) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome b561 YodB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (43/49); total (44/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAATGTAAAGATCCTGAAAGCAAAGCCCCTAAATATATACAATTTAGCGATCATATAATTGCACCACGAAAATCATCTCATTTTCACATTTTTATGGGTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATT > NC_000913/2041822‑2042394 | gAATGTAAAGATCCTGAAAGCAAAGCTCCTAAATATATACAATTTAGCGATCATATAATTGCACCACGAAAATCATCTCATTTTCACATTTTTATGGGTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGTTAGCTACAGa < 2:578497/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |