Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 2,765,794 | (C)7→8 | intergenic (‑18/‑124) | yfjM ← / → rnlA | protein YfjM/RNase LS, toxin of the RnlAB toxin‑antitoxin system |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,765,794 | 1 | . | C | 92.4% | 386.6 / 26.5 | 106 | intergenic (‑18/‑124) | yfjM/rnlA | protein YfjM/RNase LS, toxin of the RnlAB toxin‑antitoxin system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/2); new base C (40/57); total (47/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.34e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGAATTTTTTCTTGTCTGCTGGCGAATAATTACTAAGTATCGAGTTGCTGCTTGGTGAGATCAGGAAGAGGTTACCGAAACGATGGACATCATCCCCCATTTTGTGGACTG‑C‑CC‑CC‑C‑C‑‑GGTAGACGATCCTGCCCTATAGTTGGAGTGCCCCCTATTCAGGTGGCTAAATTTAGCAAATCAATACACTTCAGGGGGGTATTATTGTAGAGTTTCCCCATATGTTTCTATGGGATCCAGGAAATGACAATCAGGAGTTACAAAAACTTAAATCTGGTCAGGGCAAATATCGAGACTGAATCCAGACAATTCATTGAAAATAAAAACTATTCAATCCAATCAATTGGTCCTATGCCAGGGTCAAGGGCTGGGCTTCGGGTCGTATTTACCAGACCAGGGGTTAACTTGGCAACTGT > NC_000913/2765501‑2766090 | caGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGTTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGNAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGAATTTTTTCTTGTCTGCTGGCGAATAATTACTAAGTATCGAGTTGCTGCTTGGTGAGATCAGGAANAGGTTACCGAAACGATGGACATCATCCCCCATTTTTTGGACTG‑C‑CC‑CC‑C‑CC‑GGTAg < 2:636772/300‑1 (MQ=255) aGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGAATTTTTTCTTGTCTGCTGGCGAATAATTACTAAGTATCGAGTTGCTGCTTGGTGAAATCAGGAAGAGGTTACCGAAACGATGGACATCATCCCCCATTTTGTGGACTG‑c‑cc‑cc‑c‑ccgttaga < 2:295353/300‑8 (MQ=255) gTTGCACGCATTACTTCCTTGTTGTTAGGGTCACATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGTGCTCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGAATTTTTTCTTGTCTGCTGGCGAATAATTACTAAGTATCGAGTTGCTGCTTGGTGAGATCAGTAAGAGGTTACCGAAACGATGGACATCATCCCCCATTTTGTGGACTG‑C‑CC‑CC‑C‑CC‑GGTAGAc < 2:78267/300‑1 (MQ=255) tGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCNCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGANTTTTTTCTTGTCTGCTGGCGAATAATTACTAAGTATCGAGTTGCTGCTTGGTGAGATCAGGAAGAGGTTACCGAAACGATGGACATCATCCCCCATTTTGTGGACTG‑C‑CC‑CC‑C‑CC‑GGTAGACGa < 2:460458/300‑1 (MQ=255) 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CAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGAATTTTTTCTTGTCTGCTGGCGAATAATTACTAAGTATCGAGTTGCTGCTTGGTGAGATCAGGAAGAGGTTACCGAAACGATGGACATCATCCCCCATTTTGTGGACTG‑C‑CC‑CC‑C‑C‑‑GGTAGACGATCCTGCCCTATAGTTGGAGTGCCCCCTATTCAGGTGGCTAAATTTAGCAAATCAATACACTTCAGGGGGGTATTATTGTAGAGTTTCCCCATATGTTTCTATGGGATCCAGGAAATGACAATCAGGAGTTACAAAAACTTAAATCTGGTCAGGGCAAATATCGAGACTGAATCCAGACAATTCATTGAAAATAAAAACTATTCAATCCAATCAATTGGTCCTATGCCAGGGTCAAGGGCTGGGCTTCGGGTCGTATTTACCAGACCAGGGGTTAACTTGGCAACTGT > NC_000913/2765501‑2766090 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |