| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,577,627 | C→T | S111N (AGC→AAC) | mcrC ← | Type IV methyl‑directed restriction enzyme EcoKMcrBC subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,577,627 | 0 | C | T | 99.3% | 486.9 / NA | 137 | S111N (AGC→AAC) | mcrC | Type IV methyl‑directed restriction enzyme EcoKMcrBC subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (56/79); minor base G (0/1); total (56/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
AACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTATAATAACGCGTATTTTTTCCGCCATTCAGATAGCTGAAATGCTGCGGAGTTAAATGAAGAGTGCTAATGCCCGGTAATTTTCTATAAAGTGAACGAGCTTCATCTCTGATAGTTGAATTTAACTTTTCATGCTTAATTAATATGGCTAATGTGCTT‑TTTATAATTCGGTTAGCCAGCGTGTCTTCATTAAGCATATCAAAAGTACTGACGGTTTTCCCATGATTAAGATGGAAGCCGCGTATTGTTTTAGCAAACTCTATTCGCCCTTTGATGCCAGGAATGATCTCGGTGTTAGGATTGTAATCAAGCTCAAGCCCTCGGCGTGAAAGCTGTAAAACCCCTTTATTTAATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAG > NC_000913/4577348‑4577926 | aaCTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTATAATAACGCGTATTTTTTCCGCCATTCAGATAGCTGAAATGCTGCGGAGTTAAATGAAGAGTGCTAATGCCCGGTAATTTTCTATAAAGTGAACGAGCTTCATCTCTGATAGTTGAATTTAACTTTTCATGCTTAATTAATATGGCTAATGTGTTT‑TTTATAATTCGGTTAGcc < 1:699313/300‑1 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taattaatATGGCTAATGTGTTT‑TTTATAATTCGGTTAGCCAGCGTGTCTTCATTAAGCATATCAAAAGTACTGACGGTTTTCCAATGATTAAGATGGAAGCCGCGTATTGTTTTAGCAAACTCTATTCGCCCTTTGATGCCAGGAATGATCTAGGTGTTAGGATTGTAATCAAGCTCAAGCCCTAGGCGTGAAAGCTGTAAAGCCCCTTTATTTAATACACACCCCAGGATATCAAGAAGATTGGTAACGGGTGTGGTTTAGAGGTTTGCATGCTTAATTTCCTGTAAATAAaccccct > 2:272775/1‑297 (MQ=255) attaatATGGCTAATGTGTTT‑TTTATAATTCGGTTAGCCAGCGTGTCTTCATTAAGCATATCAAAAGTACTGACGGTTTTCCCATGATTAAGATGGAAGCCGCGTATTGTTTTAGCAAACTCTATTCGCCCTTTGATGCCAGGAATGATCTCGGTGTTAGGATTGTAATCAAGCTCAAGCCCTCGGCGTGAAAGCTGTAAAACCCCTTTATTTAATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCa < 1:113338/300‑1 (MQ=255) atgtgacTAATGTGTTT‑TTTATAATTCGGTTAGCCAGCGTGTCTTCATTAAGCATATCAAAAGTACTGACGGTTTTCCCATGATTAAGATGGAAGCCGCGTATTGTTTTAGCAAACTCTATTCGCCCTTTGATGCCAGGAATGATCTCGGTGTTAGGATTGTAATCAAGCTCAAGCCCTCGGCGTGAAAGCTGTAAAACCCCTTTATTTAATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAgg < 2:620275/294‑1 (MQ=255) 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AACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTATAATAACGCGTATTTTTTCCGCCATTCAGATAGCTGAAATGCTGCGGAGTTAAATGAAGAGTGCTAATGCCCGGTAATTTTCTATAAAGTGAACGAGCTTCATCTCTGATAGTTGAATTTAACTTTTCATGCTTAATTAATATGGCTAATGTGCTT‑TTTATAATTCGGTTAGCCAGCGTGTCTTCATTAAGCATATCAAAAGTACTGACGGTTTTCCCATGATTAAGATGGAAGCCGCGTATTGTTTTAGCAAACTCTATTCGCCCTTTGATGCCAGGAATGATCTCGGTGTTAGGATTGTAATCAAGCTCAAGCCCTCGGCGTGAAAGCTGTAAAACCCCTTTATTTAATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAG > NC_000913/4577348‑4577926 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |