| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,427,822 | 0 | C | A | 29.3% | 311.0 / 12.2 | 133 | intergenic (‑400/+257) | yjfZ/ytfB | DUF2686 domain‑containing protein YjfZ/cell division protein YtfB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/69); new base A (39/0); total (64/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.98e-17 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
AAATAGCGGATGGTGAAAGATATTAATATCAAAAATCGCTCATTATGGATATAACGATGCACCCGGGGAGAAAATGACTTCCACGCCTTACACCGTACATTCTTGTTGTGCGGTATGTAATTATTCTACGCTGTCGGTATCGGTGTATTCGTTAATCAGCAGGTTAGCCAGCCACAAAAAGCCATTGAGAAAATTATTGATTTTACATGGGATTATTATATTGCTAATCCTTGGTTTTTAAAAATTGTGCATAGTGAAAATCAAAGTAAAGGTGTGCATTATGCAAAATCACAGCGTCTCTTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAAC > NC_000913/4427523‑4428121 | aaaTAGCGGATGGTGAAAGATATTAATATCAAAAATCGCTCATTATGGATATAACGATGCACCCGGGGAGAAAATGACTTCCACGCCTTACACCGTACATTCTTGTTGTGCGGTATGTAATTATTCTACGCTGTCGGTATCGGTGTATTCGTTAATCAGCAGGTTAGCCAGCCACAAAAAGCCATTGAGAAAATTATTGATTTTACATGGGATTATTATATTGCTAATCCTTGGTTTTTAAAAATTGTGCATAGTGAAAATCAAAGTAAAGGTGTGCATTATGCAAAATCACAGCGtctc > 2:662548/1‑300 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cATTATGCAAAATCACAGCGTCTCTTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAAc < 1:53663/300‑1 (MQ=255) cATTATGCAAAATCACAGCGTCTCTTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTGCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAAc < 2:146742/300‑1 (MQ=255) aaaTCACAGCGTCTATTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGAACCATTGCAGGTGAATATTACTATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCCTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCg > 1:223828/1‑300 (MQ=255) cttctcTTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCggg < 2:90878/298‑1 (MQ=255) cttctcTTAGAAATTAACCATGCACACTTGAAGTTGATGTAGTCCTCATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGAGATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACGTCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGCCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCggg < 2:91645/298‑1 (MQ=255) ctTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAAc < 1:590332/300‑1 (MQ=255) | AAATAGCGGATGGTGAAAGATATTAATATCAAAAATCGCTCATTATGGATATAACGATGCACCCGGGGAGAAAATGACTTCCACGCCTTACACCGTACATTCTTGTTGTGCGGTATGTAATTATTCTACGCTGTCGGTATCGGTGTATTCGTTAATCAGCAGGTTAGCCAGCCACAAAAAGCCATTGAGAAAATTATTGATTTTACATGGGATTATTATATTGCTAATCCTTGGTTTTTAAAAATTGTGCATAGTGAAAATCAAAGTAAAGGTGTGCATTATGCAAAATCACAGCGTCTCTTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAAC > NC_000913/4427523‑4428121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |