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| ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 1635 total aligned reads displayed.
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cAGTACAaaccgaggccaacgaatgaacctagcaattcagatcttagcctcttacccgccatccggcaaggagaaaggctatgaagcacaaccctctgttggtgtgtctgctcattatctgcattacgattctgacattcacactcctgacccgacaaacgctctacgaactgcggttccgggacggtgataaggaggttgctgcgctcatggcctgcacgtccaggtaagggcaagcgcggggattttccccgcgcatttgactagcagattcattttctcatggcaccccttttacac > 1:240508‑M2/1‑7 (MQ=255) gTACAtcgctgggctatctggctgcggacaaaagagacgtgtttccacctgcccatattttgttggaaccatgtaagctctggttgccatttctggagcgcccgcattccagaatcggcgctcaagcgtgtaatactgtcgttgctcagcaatcgttcccgttgcgggccagggcggtaaatccggctgaagagtattcacaacggtcttcatttcagcagaaataaggtccagaacaggtagtttgttttccggcttcatacaaaaactcctttcaaattacgtcattgtaaggaacca < 2:437254‑M2/300‑296 (MQ=255) gTACAtatcagggcctgcgtcatgactctggcgacccggttgaatggggtgaaaaagccattgcacattatgaaaagctgggaattgatccacagagtaaaacgctggttttctctgacaatctggatttacgcaaagcggttgagctataccgccaattctcttcccgcgtgcaattaagttttggtattgggactcgcctgacctgcgatatcccccaggtaaaacccctgaatattgtcattaagttggtagagtgtaacggtaaaccggtggcgaaactttctgacagccctggca < 1:27858‑M2/300‑296 (MQ=255) gTACAgaacggtgctacctccttatatgatgnggtaattattattaataaaatcccccccaaaaaaattgatactaaaggagttgctactgaagaagttgctactaaaaaagtactgctgaacanattactgacaacgcaattattgaatgagccagaataagctaaggttgaaggggctggaacgccccttcaaccttagcagtagcgtgggatgatttcacaattagaaagacctgcatgatgagctagagaagaggctagtgacgcaaggcgtcgtgcaggacacggatcaccgaga < 2:527260‑M2/300‑296 (MQ=255) gTACAaaccgaggccaacgaatgaacctagcaattcagatcttagcctcttacccgccatccggcaaggaaaaaggctatgaagcacaaccctctggtggtgtgtatgctcattatctgcattacgattctgacattcacactcctgacccgacaaacgctctacgaactgcggttccgggacggtgataaggaggttgctgcgctcatggcctgcacgtccaggtaagagcaagcgcggggattttccccgcgcatttgactagcagatccattttctaatggcacccctttcacactt < 2:298995‑M2/300‑296 (MQ=255) cAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTCgcgc < 1:364821/300‑1 (MQ=255) | CGTATGAGAAGATATCAAAATATCCTTAAAGAACATGGTATTAAACAAAGCATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTCGCGC > NC_000913/3721777‑3722373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |