| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,383,055 | IS5 (–) +4 bp | coding (904‑907/999 nt) | ycjW ← | DNA‑binding transcriptional repressor YcjW |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1383058 | 1 (0.010) | 115 (1.230) | 78/598 | 0.0 | 99.1% | coding (904/999 nt) | ycjW | DNA‑binding transcriptional repressor YcjW |
| ? | NC_000913 | = 1397238 | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CGTTTCGCTGGAATACGCGTTTGAGTGGCAGGATCACGACGAAGGCGACAGTGATAAATTCCATTATGCAGGTGTCGGCGTAAATTACTCGTTCTGATAATGGGCTAAATTGCCGGATGCGGCGCGAGTACTTTATCCGATCTATAAATGTAGGCCGGATAAGATGCGCTAGCATCGCATCTGGCATTCAGGCAAGGTAGCTGGTATTTATTTCAGCGTCATATGCGTGGCAACGGTAATATTCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATGGGTATAACCGCCATCAACAATCCATTCATCACGCACTGCAATATTATGCGCAGCCAGGCTCTGCTTATAACCA > NC_000913/1382756‑1383353 | cGTTTCGCTGGAATACGCGTTTGAGTGGCAGGATCACGACGAAGGCGACAGTGATAAATTCCATTATGCAGGTGTCGGCGTAAATTACTCGTTCTGATAATGGGCTAAATTGCCGGATGCGGCGCGAGTACTTTATCCGATCTATAAATGTAGGCCGGATAAGATGCGCTAGCATCGCATCTGGCATTCAGGCAAGGTAGCTGGTATTTATTTCAGCGTCATATGCGTGGCAACGGTAATATTCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGAcc < 1:422168/300‑1 (MQ=255) gCTGGAATACGCGTTTGAGTGGCAGGATCACGACGAAGGCGACAGTGATAAATTCCATTATGCAGGTGTCGGCGTAAATTACTCGTTCTGATAATGGGCTAAATTGCCGGATGCGGCGCGAGTACTTTATCCGATCTATAAATGTAGGCCGGATAAGATGCGCTAGCATCGCATCTGGCATTCAGGCAAGGTAGCTGGTATTTATTTCAGCGTCATATGCGTGGCAACGGTAATATTCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAAgga < 1:708602‑M1/300‑4 (MQ=255) ttgGAATACGCGTTTGATTTGCAAGATCACGACGAAGGCGACAGTGATAAATTCCATTATGCAGTTGTCGGCGTAAATTACTCGTTCGGATAATGGGCGAAATTGCCGGATGCGGCGCGAGTACTTTATCCGATCTATAAATGTATGCCGGATAAGATGCGCTAGCATCGCATCTGGCATTCAGGCAAGGTAGCTGGTATTTATTTCAGCGTCATATGCGTGGCAACGGTAATATTCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAAggaa < 2:304433‑M1/299‑5 (MQ=255) ccatcgctcaggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgncttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTcc > 2:647363‑M1/293‑300 (MQ=255) 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gCTTTGTTGCCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttaatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgcttgatg > 1:163911‑M1/1‑15 (MQ=255) ttccCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATGGGTATAACCGCCATCAACAATCCATTCATCACGCACTGCAATATTATGCGCAGCCAGGCTCTGCTTATaa < 1:127704‑M1/296‑1 (MQ=255) tccCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATNTTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATGGGTATAACCGCCATCAACAATCCATTCATCACGCACTGCAATATTATGCGCAGCCAGGCTCTGCTTATAAc > 1:518805‑M1/4‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |