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| JC JC | NC_000913 | 981,494 | IS150 (+) +4 bp | coding (448‑451/1848 nt) | ldtD → | L,D‑transpeptidase LdtD |
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| ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGCGGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTA > NC_000913/981198‑981794 | attataagatatcaaaatatccttaaagaacatggtattaaacaaagcatgtccagaaaaggcaattgtctggataatgctgtggtggagtgtttctttggaaccttaaagtcggagtgtttttatcttgatgagttcagtaatataagcgaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatacgacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGACg > 1:347263‑M1/297‑300 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TGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGCGGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTA > NC_000913/981198‑981794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |