| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,190,105 | IS2 (+) +5 bp | coding (320‑324/540 nt) | yjaZ → | protein YjaZ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 99 (1.060) | 68/594 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4190109 | 0 (0.000) | coding (324/540 nt) | yjaZ | protein YjaZ | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 86 (0.920) | 59/598 | 0.3 | 98.8% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4190105 = | 1 (0.010) | coding (320/540 nt) | yjaZ | protein YjaZ | |||||
GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186392‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taCCCGGCATGAATAACGTTGCTTTCTGGCAGCGCCAAAATAGTTCTTTTTAAGTGTGTGCGCGCTAAGTTATAACGGTGCTGGCAGAAGGGACGAGATTCTTTAGGCGCGTGGTACATTAACGATTGTTTTTCTTCGTTCGTCTGATGTTCATAATCTTTTGTGAAGCAGTGAAGAGAGTAGGTAACCCAAAAGCGATACTCTAAAGGCTCTTTGCCCTCATGATGCTGAACGTAGACAGCCTGATGAGCATCAAGAAATGATAAATCACGAATATCACCATCCGGATGTCCAAAA < NC_000913/4190109‑4189815 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGTTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCC < 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AGTCTACCCGGCATGAATAACGTTGCTTTCTGGCAGCGCCAAAATAGTTCTTTTTAAGTGTGTGCGCGCTAAGTTATAACGGTGCTGGCAGAAGGGACGAGATTCTTTAGGCGCGTGGTACATTAACGATTGTTTTTCTTCGTTCGTCTGATGTTCATAATCTTTTGTGAAGCAGTGAAGAGAGTAGGTAACCCAAAAGCGATACTCTAAAGGCTCTTTGCCCTCATGATGCTGAACGTAGACAGCCTGATGAGCATCAAGAAATGATAAATCACGAATATCAACATCCGGATGTCCAAA > 2:64106/1‑300 AGTCTACCCGGCATGAATAACGTTGCTTTCTGGCAGCGCCAAAATAGTTCTTTTTAAGTGTGTGCGCGCTAAGTTATAACGGTGCTGGCAGAAGGGACGAGATTCTTTAGGCGCGTGGTACATTAACGATTGTTTTTCTTCGTTCGTCTGATGTTCATAATCTTTTGTGAAGCAGTGAAGAGAGTAGGTAACCCAAAAGCGATACTCTAAAGGCTCTTCGCCCTCATGATGCTGAACGTAGACAGCCTGATGAGCATCAAGAAATGATAAATCACGAATATCAACATCCGGATGTACAAA > 2:432428/1‑300 GTCTACCCGGCATGAATAACGTTGCTTTCTGGCAGCGCCAAAATAGTTCTTTTTAAGTGTGTGCGCGCTAAGTTATAACGGTGCTGGCAGAAGGGACGAGATTCTTTAGGCGCGTGGTACATTAACGATTGTTTTTCTTCGTTCGTCTGATGTTCATAATCTTTTGTGAAGCAGTGAAGAGAGTAGGTAACCCAAAAGCGATACTCTAAAGGCTCTTTGCCCTCATGATGCTGAACGTAGACAGCCTGATGAGCATCAAGAAATGATAAATCACGAATATCACCATCCGGATGTCCAAAA > 1:110760/1‑300 GTCTACCCGGCATGAATAACGTTGCTTTCTGGCAGCGCCAAAATAGTTCTTTTTAAGTGTGTGCGCGCTAAGTTATAACGGTGCTGGCAGAAGGGACGAGATTCTTTAGGCGCGTGGTACATTAACGATTGTTTTTCTTCGTTCGTCTGATGTTCATAATCTTTTGTGAAGCAGTGAAGAGAGTAGGTAACCCAAAAGCGATACTCTAAAGGCTCTTTGCCCTCATGATGCTGAACGTAGACAGCCTGATGAGCATCAAGAAATGATAAATCACGAATATCAACATCCGGATGTCCAAAA > 2:218577/1‑300 GTCTACCCGGCATGAATAACGTTGCTTTCTGGCAGCGCCAAAATAGTTCTTTTTAAGTGTGTGCGCGCTAAGTTATAACGGTGCTGGCAGAAGGGACGAGATTCTTTAGGCGCGTGGTACATTAACGATTGTTTTTCTTCGTTCGTCTGATGTTCATAATCTTTTGTGAAGCAGTGAAGAGAGTAGGTAACCCAAAAGCGATACTCTAAAGGCTCTTCGCCCTCATGATGCTGAACGTAGACAGCCTGATGAGCATCAAGAAATGATAAATCACGAATATCACCATCCGGATGTCCCAAA > 2:630100/1‑300 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186392‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taCCCGGCATGAATAACGTTGCTTTCTGGCAGCGCCAAAATAGTTCTTTTTAAGTGTGTGCGCGCTAAGTTATAACGGTGCTGGCAGAAGGGACGAGATTCTTTAGGCGCGTGGTACATTAACGATTGTTTTTCTTCGTTCGTCTGATGTTCATAATCTTTTGTGAAGCAGTGAAGAGAGTAGGTAACCCAAAAGCGATACTCTAAAGGCTCTTTGCCCTCATGATGCTGAACGTAGACAGCCTGATGAGCATCAAGAAATGATAAATCACGAATATCACCATCCGGATGTCCAAAA < NC_000913/4190109‑4189815 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |