Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 2,020,326 | IS150 (+) +3 bp | coding (240‑242/1005 nt) | fliM → | flagellar motor switch protein FliM |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 2020326 = | 0 (0.000) | 93 (0.990) | 60/598 | 0.3 | 100% | coding (240/1005 nt) | fliM | flagellar motor switch protein FliM |
? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 2020328 | 0 (0.000) | 111 (1.190) | 70/598 | 0.1 | 100% | coding (242/1005 nt) | fliM | flagellar motor switch protein FliM |
? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
CTCAACTTCCAGCGGATTAATCGCCTTCCAGGCGTCGCTATAGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2020620‑2020326 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 CTCAACTTCCAGCGGATTAATCGCCGTCCAGGCGTCGCTATAGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTGCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGTTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGGGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGGTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGgac < 1:188091/300‑4 CTTCCAGCGGATTAATCGCCTTCCAGGCGTCGCTATAGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACC < 1:636130/300‑1 GGATTAATCGCCTTCCAGGCGTCGCTATAGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCANCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCNGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAG < 2:528486/300‑1 GATTAATCGCCTTCCAGGCGTCGCTATAGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACTCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGTTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAGT > 1:611520/1‑300 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ATAGCCTGCAAGCACCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCTGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGTTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACATTTAAACACGAGGCATATA < 1:200520/300‑1 AGCCTTNAATCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGTGCTGTTCGGTATGGGNAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGTTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAATTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGG < 2:605382/300‑1 AGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTAGGGGTAAACTCGCGGCCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGG < 1:271631/300‑1 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CCTTCAAGCACCAGTTGCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGACGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGAGAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTC < 2:634773/300‑1 CTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGGCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTTGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTTATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCT < 1:678455/300‑1 CCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGAT < 2:625659/300‑1 AGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTNGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGNGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATAT > 2:513797/1‑300 TGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAATTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGCCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGAC < 2:277625/300‑1 CGCTGTTCGGTATGGTTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGTTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAAT < 1:120260/300‑1 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GACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGAATTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGGTATTTTGATCTCTTCTCAT > 2:154889/1‑300 ACGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < 1:608699/300‑1 CTCAACTTCCAGCGGATTAATCGCCTTCCAGGCGTCGCTATAGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2020620‑2020326 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |