| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,380,292 | 2 bp→A | coding (225‑226/735 nt) | frdB ← | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,380,292 | 0 | G | . | 95.6% | 440.2 / 13.5 | 91 | coding (226/735 nt) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (53/34); minor base A (1/3); total (54/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,380,293 | 0 | T | A | 96.7% | 308.7 / 3.8 | 91 | K75N (AAA→AAT) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/3); new base A (53/34); total (54/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
CAGCCGGACCGATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACG > NC_000913/4380001‑4380582 | cAGCCGGACCGATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCAc > 1:313214/1‑300 (MQ=255) ccGATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTCCGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTaa > 1:636413/1‑300 (MQ=255) ccGATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTaa > 1:635763/1‑300 (MQ=255) gaggAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACATTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCGGCTCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAAcc < 2:369906/297‑1 (MQ=255) gATGACCTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAACACAAACCACAGTGGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTAGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTGCGGTGTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCAGATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAAcc < 2:62815/300‑1 (MQ=255) gATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGTTGATACTTCGCCAGCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCACTTCCAGACTTTCGATGAAGTTGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAAcc < 2:311088/300‑1 (MQ=255) gATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAAcc < 2:466207/300‑1 (MQ=255) 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aCTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGCAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACcatcat > 2:687521/1‑300 (MQ=255) aCTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAAACTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACcatcat > 2:236803/1‑300 (MQ=255) ctctGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATg > 1:611128/1‑300 (MQ=255) ggCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGNTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAAcc > 1:542703/1‑300 (MQ=255) cACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGGGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATAc < 2:622746/300‑1 (MQ=255) gcggcgTAGCATAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGc < 1:302158/300‑1 (MQ=255) cggcgTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCa > 1:62114/1‑300 (MQ=255) gcgTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGNTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTANCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCCCGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCAATACGGCAgg > 2:631012/1‑300 (MQ=255) gcgTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATTGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGAACGGTTTTACATGCCA‑CTTTGGCATGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACACATCGCCATACGGCAgg > 2:404148/1‑300 (MQ=255) gcgTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTANCGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAgg > 1:574459/1‑300 (MQ=255) gcgTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAgg > 1:352533/1‑300 (MQ=255) tAGCACAAACCACAGTTGATACAACCGGAGAACTGTTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGAcc < 2:234186/300‑1 (MQ=255) 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aaCCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTa > 1:357918/1‑300 (MQ=255) caGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCa > 2:36430/1‑300 (MQ=255) tGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCNAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCTGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTc < 1:554430/300‑1 (MQ=255) 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