| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 696433 | 118 (1.150) | 3 (0.030) +C |
3/596 | 9.4 | 2.8% | noncoding (72/75 nt) | glnX | tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | 696870 = | 91 (0.880) | noncoding (70/75 nt) | glnU | tRNA‑Gln | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTACCAATTTCGCCACTCCCGCAAAAAAAGATGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCATCTTTTTTTTCGCGATACCTTATCGGCGTTGCGGG > NC_000913/696574‑697169 | gtcGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGTCGATACCCCAACAAATTGGTTTGGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTgggg < 2:405845/298‑1 (MQ=255) aaTCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGTCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCt < 1:149951/300‑1 (MQ=255) gAATCCGGTGCCTTACCGCTCGGCGATACCCCAACAAAGTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGAtt < 2:399071/300‑1 (MQ=255) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCATATTTTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGACACAGGAAATGCCGATATCACCAACCAGTGCATTCCCGCTTGGC‑ACTCCCAAACTCACCGGGCGGTAACCCGCTTACTAGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACAAgg > 1:606484/1‑300 (MQ=25) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg > 1:417004/1‑300 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGa < 1:92106/300‑1 (MQ=255) gcGCTTGGAGATACCCCAACAAATTGGGTTTGAATTTGCTGAACATATTCGATACATTCAGGATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGGGATGTGCGCGAACTAACTGAGCTACGTGGCCAGATTGTTTTTGCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGc < 2:493960/299‑1 (MQ=38) ccGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGATTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGc < 1:175844/300‑1 (MQ=255) ccGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGc > 1:303470/1‑300 (MQ=255) ccccAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGACTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTCCTGCTTGGCGATACCCCAA‑TCACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGGTGGCTGAGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCACAAAc > 2:136582/1‑300 (MQ=255) tGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCATAATTTGTTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGTTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGTTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCTAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTAc < 2:265900/300‑1 (MQ=255) gTTTTGAATTTGCCGAACATATTCAATACATTCAGAATTTGTCGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCAGTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCg < 2:392891/300‑1 (MQ=255) gttgtcnaacggatTCGATGCATTCAGAATTTGGTGGCGACGACGGGATTCGAANCTGTGACCCCAGCATTATGAGTGATGTGCTCGAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCGGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGa < 2:661865/288‑1 (MQ=38) cGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTGCGACTGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACTTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 1:391129/300‑1 (MQ=255) cGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGATTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 1:403898/300‑1 (MQ=255) cGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 1:697820/300‑1 (MQ=255) cGAACATATTCGATACATTCAGAATGGGGTTGCTACGTAGGGATTTGAACCTGTGACCTCGTCATTGTGAGTGATCTGCTAGAACCAACGGAGTCATGTAGACAGGTTGTTGCTTCGGTTGCGGGGGTATCGTGATTCGAACTGGGGAATGCCAGTAGCAAAAATCGTTGCCTTACTGTGTGGCGATACAACAA‑TAAACGGGCGTGGAGCCGCTGGCTTGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCGTGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 1:441516/300‑1 (MQ=255) cGAACATATTCGAGACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGAGTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAATCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 1:400448/300‑1 (MQ=255) atagtCGATATATTCGGAATTTGGTGGCGGCGACTGGAGTCGAGTCTTTTATCCCATTATTATGAGTGATGTGCGATAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTTTTTCTGCGGTGGCTGTGGTACCGGGATTCGAACTAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCGTACCGCGTGGCGAGACCACAA‑TAACCGGGCGGTGAACCACTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATcc < 2:37618/296‑1 (MQ=21) atTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAC‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGt > 1:41988/1‑300 (MQ=255) aTACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGATTGATGTGCCCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTGCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAGGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCGTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAAc < 1:155775/300‑1 (MQ=255) aCATTCAGAATTTGTTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTAGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAACGc < 1:122692/300‑1 (MQ=255) aTTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAACGCtt > 1:765499/1‑300 (MQ=255) gccgggattttagccTGTGACCTCATTATTATGGGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTGTGTAGCCAGATTGTCTCTTCGGCGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACTAGGGAATGCCGTTATCAAACACCGTGGCCTTAACGTTTGGCGATACCCCAA‑GAAACGGGCGGTGAACCGCTGACTCGGAGAAGATGGCTGGGGTACTGGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAGCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAg < 2:367264/287‑1 (MQ=255) gacgGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCGGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTAGCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGATGAACCGCTTGCTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAg < 1:637046/300‑1 (MQ=255) aTTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGTCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCAGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCgaga > 1:215536/1‑300 (MQ=255) aTTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAC‑TAACCGGGCGATGCCCAGCTTACTCGACGAAGGTGGCTAGGGTACCTGGACCCGCCCCAGGAAATGCAGGTCTCACCAACCGGTGCCTTCCCTCTTGACGATACCCAATCCACA‑CACAGTTTTTTGTTGAATGGTGCTGGCGGCgaga > 2:171599/1‑300 (MQ=19) aTTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATACGTA‑CAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCgaga > 1:215952/1‑300 (MQ=255) 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atcatTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTAGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCtt > 1:282901/1‑300 (MQ=255) atTATGGGTGATATGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATTGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTA‑CAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcg < 1:154248/300‑1 (MQ=255) atTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCACAAACCGGTGCCTTCCCGCTTGGCGATACCCCAA‑TAACCGGGCGGTGCACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAACGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTC‑CAACGTTTCCTGGTGAGGGGTGCTGGAGGCGACACTTGAATTCCCACACCTTgcg > 2:260555/1‑300 (MQ=38) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |