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| ? | NC_000913 | 2101749 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
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CATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCAAGAGCATTACTATTCAGACTTAGCTTTACGAGTCTATCGTAGTTGGTTGCATCAAAATGTGTGAATTGGTTATTATCAAGATTGATAGATGTGAAGTTTTGCAGCCCTGGTGGTTGAGTGGTTAAATTAAGTCCTGATAAATCAATGGTCACTTCATTAGTGTCATCAATTATATTTCTTACTGCAGTCCAGTACTGCATTTGTGCAAGTGGATCATTGTTGATGCCGTTAACTAATACATGCCAAAGATGTTTTGATGATATTAGTTGATCAATGTCATTGGTTGGCAGTAAATTGTTATTGCTTAAGTTTAAATATTCCAGTTTTGTAGTGTTTTTGGCGTTTAAATGTGCAATATGGTTGTCGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATATTGTGATGGGCACTTAACTCAATCAGAGATTCTTGCCGCGCGAGCCGTTGGCTTCATCGTTATAGCCTTTAAAATCATATTCCCAGTGACCAAAACCAATCATTTGATCATTGATTTGCGTTTCTCCTTTAAAGCCGAGAC > NC_000913/1545261‑1545856 | cATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCAAGAGCATTACTATTCAGACTTAGCTTTACGAGTCTATCGTAGTTGGTTGCCTCAAAATGTGTGAATTGGTTATTATCAAGATTGATAGATGTGAAGTTTTGCAGCCCTGGTGGTTGAGTGGTTAAATTAAGTCCTGATAAATCAATGGTCACTTCATTAGTGTCATCAATTATATTTCTTACTGCAGTCCAGTACTGCATTTGTGCAAGTGGATCATTGTTGATGCCGTTAACTAATACATGCCAAAGATGTTTTGATGATATTAGgg < 2:686211‑M1/300‑3 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |