| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_000913 | 1287624 = | 33 (0.450) | intergenic (‑2/+158) | tyrT/purU | tRNA‑Tyr/formyltetrahydrofolate deformylase | |||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAC > NC_000913/1287031‑1287624 | gatgcggcgtagagTCCAGGGACTTTTGAAATTGATG‑TGGTTGGGTGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCGCCTCACCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATGTAATTGCGGAGTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAg < 2:269499/290‑1 (MQ=21) tcgtgggagaGTTTGGGGACTTGTGAAAGTGATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAgggg < 2:101273/294‑1 (MQ=21) gagtaacaggttttgattatttaaggaagcgATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCTGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAgggg < 1:449666/270‑1 (MQ=18) gagtaacagattttaattacttaaggaagcgATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAgggg < 1:771180/270‑1 (MQ=18) aagatctaggtttcaatgacttaaggaagcgATGGTGGT‑GCGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCTGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGGCGGACCTGGGTCGGGGCTTTTCATCCTTCCCCGCATGGGCGGAATGTTTAGGTGTGGATGCG‑GTGGGGAGTTCAGGGATTTGGGGAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAgggg < 2:678637/270‑1 (MQ=16) cGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACACCACCAGGGGt > 2:519381/1‑300 (MQ=255) cTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTTGGACGTTCAGGGACTTTTGAACGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGCCCCTTCGCCGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGCACCCCACCAGGGGtca > 1:763303/1‑298 (MQ=18) tagggtttaggtacttgggaacgcgATGGTGGT‑GTGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCNCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTc < 2:706240/276‑1 (MQ=21) tagggttcggtgacttaagAAAGCGATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTc < 1:13236/282‑1 (MQ=255) gTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGACCCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGAATGGGCAGCATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGANAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGACCCTTCGAAGTCGCTGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCacct > 2:700293/1‑297 (MQ=21) 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gggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg < 1:772744/300‑1 (MQ=255) gggtaaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTgggg < 1:674091/296‑1 (MQ=255) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGTTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCNACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCNGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTgggg < 2:748075/300‑1 (MQ=255) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTgggg < 1:99309/300‑1 (MQ=255) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTgggg < 1:718547/300‑1 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCG‑TTTGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGACGTCGCTGACGGCAGAGTTCGAGTCTGCGCACTTTGGCCGCTCGGGAACCCCAACANGGGTAATTCACATTTTGTGGTAATGCTTGAGAttgtctattatacacctcgcgc > 2:591116/1‑279 (MQ=17) 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GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT‑GGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG‑AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAC > NC_000913/1287031‑1287624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |