| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 3,361,576 | Δ3,980 bp | IS5‑mediated | [gltF]–[yhcE] | [gltF], yhcA, yhcD, [yhcE] |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 148 (1.450) | 92/596 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3361575 | 0 (0.000) | coding (400/765 nt) | gltF | periplasmic protein GltF | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
ATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCAACGCTAATTGCTGTAACCTCCAAGGATAACCGTCAGTCGACCATTGTAGCGTTAAACGACACATCCTATATTGAAAAAGCTTATGATACTCTCGTAGATATGAAGGGAACGAAAAACGCCTTTGGTTTAGGTTCTGCGCCTAATGGACAAAAAATTGGCGCTGCATCCATTGGTATTGACAGGTCTAATGGTGGGATTCACGCGGCGGACGATACAGGTGAAATTCCTGTCGACCTGATTCAAACTGACCACTGGTCAGCAGCGACCCCCACATGGAAAGCCTCATCTAATGGCGCATTCTGCTCGCTGACAAGTTGCTCAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACA > NC_000913/3361278‑3361869 | aGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGTGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCACCGCTAATTGCTGTAACCTCCAAGGATAACCGTTAGTAGACCATTGTAGCGTTAAACGACACATCCTATATTGAAAAAGCTTATGATACTCTCGTCGATATGAAGGGAACGAAAAACGCATTTGGTTTAGggaaggtgcgaa < 1:149801‑M2/300‑13 (MQ=255) 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ATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCAACGCTAATTGCTGTAACCTCCAAGGATAACCGTCAGTCGACCATTGTAGCGTTAAACGACACATCCTATATTGAAAAAGCTTATGATACTCTCGTAGATATGAAGGGAACGAAAAACGCCTTTGGTTTAGGTTCTGCGCCTAATGGACAAAAAATTGGCGCTGCATCCATTGGTATTGACAGGTCTAATGGTGGGATTCACGCGGCGGACGATACAGGTGAAATTCCTGTCGACCTGATTCAAACTGACCACTGGTCAGCAGCGACCCCCACATGGAAAGCCTCATCTAATGGCGCATTCTGCTCGCTGACAAGTTGCTCAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACA > NC_000913/3361278‑3361869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |