| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 335,512 | IS5 (+) +4 bp | coding (233‑236/606 nt) | yahD → | ankyrin repeat‑containing protein YahD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 118 (1.150) | 75/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 335512 = | 0 (0.000) | coding (233/606 nt) | yahD | ankyrin repeat‑containing protein YahD | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 120 (1.170) | 82/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 335515 | 0 (0.000) | coding (236/606 nt) | yahD | ankyrin repeat‑containing protein YahD | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/274863‑275149‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCTTGCTTATTAATATCCGCTCCGGCATCAATTAATGCCTGAACGCAAGCATATTGCTGATATAAACTTGCCAGCGTAATTGCCGTTTTCCCCTGACGATCGCAGGTATTAATATCGACACCCAGCGCAAGGCAGGTTTTTACTTTATCGATATCACCCTGTTGTGCAGCCAATAAATAGTCGGCAGGTAGATTTTTTATACTCATTCACATTCCCCTGGTTTTTGTGGCTGTTTTCGATGAATTGAGAATAGCAACGATAATC < NC_000913/335515‑335222 GCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCANTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTCATTAAAAAAG > 1:562413/1‑300 atGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAGTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCATGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATT > 2:381000/3‑300 GGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTT > 1:668620/1‑300 CCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGG > 1:753691/1‑300 ATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCATGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAAGGACTTGTTTGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTAT > 2:237053/1‑300 ATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCAACATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTAT > 2:209672/1‑300 GCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGA > 1:706179/1‑300 TGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATC < 1:324116/300‑1 GCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCT > 1:752779/1‑300 GCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCTTGCT < 1:460842/300‑1 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GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCTTGCTTATTAATATCCGCTCCGGCATCAATTAATGCCTGAACGCAAGCATATTGCTGANATAAACTTGCCAGCGTAATTGCCGTTTTCCCCTGACGATCGCAGGTATTAATATCGACACCCAGCGCAAGGCAGGTTTTTACTTTATCGATATCACCCTGTTGTGCAGCCAATAAATAGTCGGCAGGTAGATTTTTTATACTCATTCACATTCCCCTGGTTTTTGTGGCTGTTTTCGATGAATTGAGAAT < 1:572353/300‑1 CTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGTTATGATCTTGCTTATTAATATCCGCTCCTGCATCAATTAATGCCTGAACGCAAGCATATTGCTGATATAAACTTGCCAGCGTAATTGCCGTTTTCCCCTGACGATCGCAGGTATTAATATCGACACCCAGCGCAAGGCAGGTTTTTACTTTATCGATATCACCCTGTTGTGCAGCCAATAAATAGTCGGCAGGTAGATTTTTTATACTCATTCACATTCCCCTGGTTTTTGTGGCTGTTTTCGATGAATTGAGAATAGC < 1:47666/300‑1 CTTGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCTTGCTTATTAATATCCGCTCCGGCATCAATTAATGCCTGAACGCAAGCATATTGCTGATATAAACTTGCCAGCGTAATTGCCGTTTTCCCCTGACGATCGCAGGTATTAATATCGACACCCAGCGCAAGGCAGGTTTTTACTTTATCGATATCACCCTGTTGTGCAGCCAATAAATAGTCGGCAGGTAGATTTTTTATACTCATTCACATTCCCCTGGTTTTTGTGGCTGTTTTCGATGAATTGAGAATAGC > 1:745119/1‑300 TGTTCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCTTGCTTATTAATATCCGCTCCGGCATCAATTAATGCCTGAACGCAAGCATATTGCTGATATAAACTTGCCAGCGTAATTGCCGTTTTCCCCTGACGATCGCAGGTATTAATATCGACACCCAGCGCAAGGCAGGTTTTTACTTTATCGATATCACCCTGTTGTGCAGCCAATAAATAGTCGGCAGGTAGATTTTTTATACTCATTCACATTCCCCTGGTTTTTGTGGCTGTTTTCGATGAATTGAGAATAGCAA < 2:690490/300‑1 TCGCACCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCTTGCTTATTAATATCCGCTCCGGCATCAATTAATGCCTGAACGCAAGCATATTGCTGATATAAACTTGCCAGCGTAATTGCCGTTTTCCCCTGACGATCGCAGGTATTAATATCGACACCCAGCGCAAGGCAGGTTTTTACTTTATCGATATCACCCTGTTGTGCAGCCAATAAATAGTCGGCAGGTAGATTTTTTATACTCATTCACATTCCCCTGGTTTTTGTGGCTGTTTTCGATGAATTGAGAATAGCAACGA < 1:167664/300‑1 CCTTCCCTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCTTGCTTATTAATATCCGCTCCGGCATCAATTAATGCCTGAACGCAAGCATATTGCTGATATAAACTTGCCAGCGTAATTGCCGTTTTCCCCTGACGATCGCAGGTATTAATATCGACACCCAGCGCAAGGCAGGTTTTTACTTTATCGATATCACCCTGTTGTGCAGCCAATAAATAGTCGGCAGGTAGATTTTTTATACTCATTCACATTCCCCTGGTTTTTGTGGCTGTTTTCGATGAATTGAGAATAGCAACGATAATC < 1:780131/300‑1 GCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/274863‑275149‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAATTAAAAAAGGATTTAAACAGGTATGATCTTGCTTATTAATATCCGCTCCGGCATCAATTAATGCCTGAACGCAAGCATATTGCTGATATAAACTTGCCAGCGTAATTGCCGTTTTCCCCTGACGATCGCAGGTATTAATATCGACACCCAGCGCAAGGCAGGTTTTTACTTTATCGATATCACCCTGTTGTGCAGCCAATAAATAGTCGGCAGGTAGATTTTTTATACTCATTCACATTCCCCTGGTTTTTGTGGCTGTTTTCGATGAATTGAGAATAGCAACGATAATC < NC_000913/335515‑335222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |