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Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
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gTACAggccgaggctccccaccggcgcgggcgtttttgtccggtaactgctgtaggtgcgggagaggatgaacggcagcgggccgggcagggcgatgtcggtttcaccgggaaggacctttgcaccgagcaggggattgaccggatggccggacgtcactccgccggggcacaccgaacaggccacgccggtgggggcaccaatgcgcaccccggctgaaccctgaacaatgctaccgccatactgcgtcatgtcgccctgacgcgctgccggttttccgctcatttctcatccttgttt > 1:165863‑M1/1‑5 (MQ=255) gTACAggccgaggctccccaccggcgcgggcgtttttgtccggtaactgctgtaggtgcgggagaggatgaacggcagcgggccgggcagggcgatgtcggtttcaccgggaaggacctttgcaccgagcaggggattgaccggatggccggacgtcactccgccggggcacaccgaacaggccacgccggtgggggcaccaatgcgcaccccggctgaaccctgaacaatgctaccgccatactgcgtcatgtcgccctgacgcgctgccggttttccgctcatttctcatccttgttt > 2:697043‑M1/1‑5 (MQ=255) gTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTANAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTcg > 1:519611/1‑300 (MQ=255) | CGTATGAGAAGATATCAAAATATCCTTAAAGAACATGGTATTAAACAAAGCATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTCG > NC_000913/3721777‑3722370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |