| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2653502 | 91 (1.020) | 6 (0.080) | 6/530 | 6.7 | 7.5% | intergenic (‑47/‑353) | timR/ryfA | putative small regulatory RNA TimR/small regulatory RNA RyfA |
| ? | NC_000913 | 2653825 = | 67 (0.850) | intergenic (‑370/‑30) | timR/ryfA | putative small regulatory RNA TimR/small regulatory RNA RyfA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCTCTGGTGTAACGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCTTATTAGTCCGAATTCAGACAAATATAAATAAATCCTGCTCAAAATTAAAAATTCTAACCGGTAAAAGATATTACTTAAACATGTAAATTCACTTTCCTTTAAAAAACAAAAAACCGCCAAAATCAGGCGGTTTTTTGTTGCTGGTCCGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGTATTACCGTAGTAATGCAAGCGCGTCTCAGCGGAGACAATACTCG > NC_000913/2653209‑2653790 | gCTCTGGTGTAACGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCC‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGGGTAgttat > 1:341300/1‑300 (MQ=255) ggTGTAACGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCCGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAATAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGttt > 2:369121/1‑300 (MQ=255) ggTGTAACGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGttt > 1:48322/1‑300 (MQ=255) gtgtAACGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGCCTTGTGTTAGGCGCGCAAAGACGGTGCTTCGCAGCA‑AAGNACTACTCACCAGTCCCTCTCTTTTTATCAAGCAAGAGAGAGTagtgcttgttta > 2:529306/1‑289 (MQ=255) gtgtAACGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGttta > 2:7444/1‑300 (MQ=255) gtgtAACGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCAAAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGttta > 2:59194/1‑300 (MQ=255) tgtAACGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGtttat < 1:455890/300‑1 (MQ=255) gacattccGTGGTTGTGTTAGCACTCTCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCAGGGAGTGAATGGTGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGGGAAATAAGTATTTTACAGGCAAGAAAAAACCGCCGAATTGGGCGGTTTTTTGTTGCTGGTCCGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGG‑‑‑‑‑TTGTATTACCGTAGTAATGCAAGCGCGTCTCAGCGGAGACAATACTCGCCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTTATTATTGttctgttagtgtat < 1:425771/294‑13 (MQ=2) cGGCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGc < 1:138435/300‑1 (MQ=255) gCAGCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGt < 1:421357/300‑1 (MQ=255) gCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTGGTAAAGCAAAAGAGAGTGATTATTGTTTCGTTAGTGtatt > 2:609533/1‑300 (MQ=255) gCCGTGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGG‑‑‑‑‑TTGTATTACCGTAGTAATGCAAGCGCGTCTCAGCGGAGACAATACTCGCCAGTAACTCTCTTTTTGTCCAGCAAAAGAGAGGTATTATTGttctgttagtgtatctgtc > 2:419584/1‑283 (MQ=17) tGGTTTTGTTAGCACTCGCGATGCTGAATGTGCCAAACGGGAAACTGTACGATGGCGCATGGATTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTATCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTCTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AGACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCg < 2:88219/300‑1 (MQ=255) tGGTTTTGTTAGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCg < 1:445241/300‑1 (MQ=255) aGCACTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGccc < 1:678448/300‑1 (MQ=255) cgctcgACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATGTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTc < 2:300181/296‑1 (MQ=255) cTCGCGACGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTCATTATTGTTTCGTTAGCGtatccgcgacctatacacatct > 2:456787/1‑281 (MQ=255) tgACGCTGGATACGCAAAACGTCAAACTGTACGACGTCGCATGTAGTGAGTGGGGCGCGCGGGCAGATCTACCAGTCGAGCCAGCGAAATAGGTATGTTACAGGCAAGAAAAAACCGCCGAATGAGGCGGGTTGTTATTGCTAGTCGGGTTTGCTTCCTTTCCAGCAGGTTGACTNTGGTGACATGAGAAAAGAGGGTGCTTCACACAA‑AAACAATACTCGCCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTTATTATTGTTCTGNTAGTGTATTATCCACTGCGGCCCTTTccgcc < 2:513098/299‑1 (MQ=12) gACGCTGGATGTGCCAAATGTGAAACTGTACGACTGCGCAGGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCATTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGTTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTccgccg < 2:229558/300‑1 (MQ=255) aCGCTGGATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCAAAGCA‑GAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAGCTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACCCCGGCCCTTTCCGCCgt > 2:56816/1‑300 (MQ=255) ggATGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCg > 2:247520/1‑300 (MQ=255) aTGTGCCAAACGTGAAACTGTACTACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGt < 2:399774/300‑1 (MQ=255) aTGTGCCAAACGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGt < 1:40930/300‑1 (MQ=255) aaaCGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTaataaaa < 1:295985/300‑1 (MQ=255) aCGTGAAACTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGCCTTGTGTTAAATGAGCAACGAAGGTGCTTCAAAGCA‑AAAAAACACCCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAGTTCTTGTTTATTTCGCGCACTACCGACACCGGCCCCTTCCGCCGTGTTCGGTaatacaata > 1:623627/1‑300 (MQ=255) ctgcacgacgGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGGGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTGTCGACACCGGACCTTTACGCAGGGTTCGGTAGTAAAACAACATGGCt > 2:69780/5‑300 (MQ=255) cTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGCGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGGGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAAACTGGCt > 1:261109/1‑300 (MQ=255) cTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCt > 2:547115/1‑300 (MQ=255) cTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCt > 1:52343/1‑300 (MQ=255) cTGTACGACGGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTAACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGTGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAGTAACCTGGCt > 1:36036/1‑300 (MQ=255) acgacgGCGCATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCttatt < 1:353755/300‑1 (MQ=255) cgcATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGCCTTGTGTTACCCGAGCAACGCAGGTGCGTCAAAGCA‑AACCAATACTCACCAGTCCCTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAGTTATTGTTTATTTCGTGTCTTACCGAAACCGGCCCCTTCAGCTGGGTTCGGTAATATAATAACATGGCTTACTATTCCgc > 2:442939/1‑299 (MQ=255) cgcATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCANAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCTTATTAgcacga > 2:172094/1‑295 (MQ=255) cgcATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGAAACCGGCACTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCTTATTAGTCCGa > 1:65703/1‑300 (MQ=255) cATGGAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAACAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGAATTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCNTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAATTATTGTTTATTTAGCGTACTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCTTATTAGGCCGAAt > 2:628810/1‑300 (MQ=255) gAGTGAATGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGCCTTGTGTTACCTGCGCAACGCCGGCTCTTCACAGCC‑AACCAATACCCACCAGTCCCTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGGGAGTAGTTATTGTTTATTTAGCGCCTTACCGACACCGGCCCTTCCCGCTGTGTTCGGTAATAGAGTAACCTGGCTTATTAGTCCGAATTcgg > 1:305797/1‑298 (MQ=255) gaTGGGGCGCGCGGGCAGATTTACCGGTTGAGCCAGTGAAATAAGTATTTTACAGGCAATAAAAAACCGCCGAATTTGGCGGTTTTTTATTGCTAGTCTGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGACTTGTGTTACATGAGCAACGCAGGTGCTTCACAGCA‑AAACAATACTCACCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTAGTTATTGTTTATTTAGCGTATTATCGACACCGGCCCTTTCCGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCTTATTAGTCCGAATTCAGACaaa > 1:265819/2‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |