| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 572,138 | IS2 (+) +5 bp | coding (685‑689/798 nt) | ybcM → | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 90 (1.010) | 64/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 572142 | 0 (0.000) | coding (689/798 nt) | ybcM | putative DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
| * | ? | NC_000913 | 572138 = | 0 (0.000) | 113 (1.270) | 74/598 | 0.1 | 100% | coding (685/798 nt) | ybcM | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CAAAGAATTGCAGGTGCATTTCTGCATCTGTGAAGGGAGAAGAGAGTTTGGATTGTATGTGCGCATAAACGTCCCCGTTTAGCGCAGAAGTCACCGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATCTTTCAGTAAAACGAGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/572433‑572138‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCA > NC_000913/1467910‑1468176 CAAAGAATTGCAGGTGCATTTCTGCATCTGTGAAGGGAGAAGAGAGTTTGGATTGTATGTGCGCATAAACGTCCCCGTTTAGCGCAGAAGTCACCGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGGAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATCTTTCAGTAAAACGAGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGA < 1:691475/300‑1 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GTTTGGATTGTATGTGCACATAAACGTCCCCGTTTAGCGCAGAAGTCACCGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATCTTTCAGTAAAACGAGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 2:128509/300‑1 gGGATTGTATGTGCGCATAAACGTCCCCGGTTAGCGCAGAAGTCACCGGAGTTGTTCAGGCTCCGTTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATCTTTCAGTAAAACGAGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 2:46443/299‑1 TGGATTGTATGTGCGCATAAACGTCCCCGTTTAGCGCAGAAGTCACCGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATCTTTCAGTAAAACGAGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:377727/300‑1 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GTAAAACGAGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCG > 2:281872/1‑300 AACGAGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGT > 1:249825/1‑300 aagagacagCTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCNGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCGCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTC < 2:169438/291‑1 AGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCTTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTC < 2:2972/300‑1 CTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCctgtctctt > 1:170259/1‑291 CTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCA > 1:181146/1‑300 CAAAGAATTGCAGGTGCATTTCTGCATCTGTGAAGGGAGAAGAGAGTTTGGATTGTATGTGCGCATAAACGTCCCCGTTTAGCGCAGAAGTCACCGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATCTTTCAGTAAAACGAGAAGGACACTTATAACCATTTTCTCTGGCAATCTCGCTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/572433‑572138‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCA > NC_000913/1467910‑1468176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |