| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,774,947 | G→A | G544S (GGT→AGT) | yfjW → | uncharacterized protein YfjW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,774,947 | 0 | G | A | 99.2% | 424.5 / NA | 120 | G544S (GGT→AGT) | yfjW | uncharacterized protein YfjW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (59/60); minor base C (1/0); total (60/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCAACGGGAAACATTTGTCGTTAAGGCCAGAATCGGAGATTATTATTTCTGAAGGGAGTTTGTATGGACTAGTTAATAAAAGCAAAAAAATCAAAATATATGGCACAGCAGATCTTGTTTTTGTTGATAACAAGATAATGAACCTTCGTAAAATAACTTATTTGCAATCTAAGCTAGAAATTTTTGGTTCTTCTATTATGGATATATTAAAGTATATATTTGGTTTAGGTCTGCTAGCAATTTCTATAAAATTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGAAAAGCCAGAAATATGCCGAGCCAGCGGCATGGAAGCGCCAGC > NC_000913/2774651‑2775241 | aaaTATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCAACGGGAAACATTTGTCGTTAAGGCCAGAATCGGAGATTATTATTTCTGAAGGGAGTTTGTATGGACTAGTTAATAAAAGCAAAAAAATCAAAATATATGGCACAGCAGATCTTGTTTTTGTTGATAACAAGATAATGAACCTTCGTAAAATAACTTATTTGCAATCTAAGCTAGAAATTTTTGGTTCTTCTATTATGGATATATTAAAGTATATATTTGGTTTAAGTc < 1:58874/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |