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Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
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aaTTACCTGTAAAGTAGTG‑TCTCATTACCCGCCTCACAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTCGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACtt > 1:402026/1‑300 (MQ=255) gTAAAGTAGTG‑TCTCATTCCCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCCAACGTCTCTTTCAGGTCAAAAGATTGAACTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACCCCCATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTCGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAAAGTAAAGCCTGGATGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCCCTTTTCTGggt > 1:268462/1‑300 (MQ=255) gTAAAGTAGTG‑TCTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGggt < 1:511348/300‑1 (MQ=255) cTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTANAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGNCGCAct > 2:534899/1‑300 (MQ=255) cTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTAATCGTATGATTAATTACCCCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTCTCTGGGTGGTTGTCGCAct > 1:209007/1‑300 (MQ=255) tAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCActg > 2:382048/1‑300 (MQ=255) | GGTTTTCGCCGTAGTACTTTCTTGCGCAGTTATATGTATGATTTCATTCAGCGTTTTGCACCGCATTTAACGCGTGATGTCGTTGATGCGGCTGTCGCATTGCGCTCTAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGTTATTTTCGGCACCTTTTATGTAGCGAAGGTGCCGGAATATATTCTCTTTTGTTACTTATTTCTATACCGTGCACAATATTTTTATCCCTCATATTTATAGGGTAAATTACCTGTAAAGTAGTG‑TCTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCACTG > NC_000913/1334671‑1335264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |