Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 1,792,772 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑41/+33) | nlpC ← / ← btuD | NlpC/P60 family lipoprotein NlpC/vitamin B12 ABC transporter ATP binding subunit |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 71 (0.720) | 49/598 | 0.8 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1792776 | 0 (0.000) | intergenic (‑45/+33) | nlpC/btuD | NlpC/P60 family lipoprotein NlpC/vitamin B12 ABC transporter ATP binding subunit |
CGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651256‑1651548 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GCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGAACGCCGTATCGT > 2:35244/1‑300 GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGTGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATGAAAAACAGAGGANCCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGG < 2:182131/300‑1 TGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACTGGAATATCGTCGGCAGCGGGCTTGTGATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCATACGCTAAATGAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGT < 2:320682/300‑1 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ggaagataTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATATGGGCAAAGCCAGACGCTAAAGTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACNATACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTCATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGAC < 1:552895/292‑1 GGAATATCTGCTGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCACGACGCGGCGCGGCGTGGAC < 2:360580/300‑1 GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGTTTAAGTGATAACAGATGGCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAACACTGCTTCGGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTTGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGAC < 2:62081/300‑1 GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGANATATAGGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGAC < 2:585979/300‑1 GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATATGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGAC < 1:403849/300‑1 GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGGCTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGAC < 1:769110/300‑1 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GAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCACCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGACT < 1:40839/300‑1 ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGACTGT < 1:709150/300‑1 CGGCAGCGGGCTTGTAATGGTTTAAGCGATAACAGAGGTTTGGAAATATATGGGCAAATCCAGACGCGAAATTAAGGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGGTTCTGCCTTATTTTGGTCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCNCCAAAGGCCAGACTTTCGGAGTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAGCGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCATTATGGGGGNATGACGCGGCGCGGTGTGGACTGTTCGGGAT < 2:561085/300‑1 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AATATAGGGGCAAATCCAGACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACTGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGACTGTTCGGGATTTGTGGTTGTGACGATGCGCGATCGTTTCGATTTGCAGCTGCCC < 1:675687/300‑1 CGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651256‑1651548 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GACGCTAAATTAATGCAAGAATAAAAAACAGAGGAACCGTACGGAATGCGTTTCTGCCTTATTTTGATCACAGCACTGCTTCTGGCCGGGTGTAGCCACCATAAAGCACCGCCGCCAAATGCCAGACTTTCTGATTCGATTACCGTTATTGCCGGTTTGAACGACCAGCTACAAAGCTGGCATGGCACGCCGTATCGTTATGGTGGCATGACGCGGCGCGGTGTGGACTGTTCGGGATTTGTGGTTGTGACGATGCGCGATCGTTTCGATTTGCAGCTGCCC < NC_000913/1792776‑1792495 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |