| Read alignment evidence... | |||||||||||
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gAGCTATACCATGCCGTTCTGGGTGGTGATTTTCGCCGCGTTGTTTCTCGGTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGc > 1:31554/1‑300 (MQ=255) aCCATGCCGTTCTGGGTGGTGATTTTCGCCGCGTTGTTTCTCGGTGACCGCCTTCTCCTTGAGCAGTATTTAGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTACGGCGTCAGGTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGTGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTg > 2:179082/1‑300 (MQ=255) ccATGCCGTTCTGGGTGGTGATTTTCGCCGCGTTGTTTCTCGGTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTgg < 1:511682/300‑1 (MQ=255) 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gttTCTCGGTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCgt > 1:643332/1‑300 (MQ=255) ctcGGTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGTTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTc < 1:238760/300‑1 (MQ=255) cGGTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTg > 1:270436/1‑300 (MQ=255) 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TATAGCTGGATTTTCATGAAGCAAGTCACCAGTTACATCGGTGCCTTCGACTTTACCGCCTTACGCTGCATTTTCGGCGCTCTCGTTTTATTCATCGTCCTTTTATTACGTGGTCGCGGAATGCGCCCGACACCGTTTAAATACACCTTAGCCATTGCCCTGTTACAAACCTGCGGGATGGTTGGTCTGGCGCAGTGGGCGTTGGTCAGCGGAGGTGCGGGGAAGGTGGCGATCCTGAGCTATACCATGCCGTTCTGGGTGGTGATTTTCGCCGCGTTGTTTCTCGGTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTGGG > NC_000913/4136177‑4136762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |