| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3469004 | 92 (1.130) | 5 (0.060) | 4/586 | 6.7 | 5.3% | coding (850/2694 nt) | chiA | endochitinase |
| ? | NC_000913 | 3469308 = | 89 (1.120) | coding (546/2694 nt) | chiA | endochitinase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATGGGTTATTGGAGTTTTCAGCGCTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCCGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTACTGGT > NC_000913/3468710‑3469295 | aTGGGTTATTGGAGTTTTCAGCGCTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTgttg < 1:310332/300‑1 (MQ=255) ggTTATTGGAGTTTTCAGCGCTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCNCCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCAAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTgttgccg > 2:553658/1‑300 (MQ=255) gAGTTTTCAGCGCTGGTACCCCGTGTGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGNTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGNAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCcgcg < 2:428749/300‑1 (MQ=255) ttttCAGCGCTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTATACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTAGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCTGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGa < 1:625579/300‑1 (MQ=255) cTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTTTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGc < 2:353046/300‑1 (MQ=255) cTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGTTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTAACATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGc > 1:124439/1‑300 (MQ=255) cTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAGTCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTACGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGc > 2:279737/1‑300 (MQ=255) cTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTCGCAGCGCGAACATaaagc > 2:16354/1‑297 (MQ=255) cTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATCATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACga > 2:16309/1‑299 (MQ=255) cTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAAACGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGc > 2:535247/1‑300 (MQ=255) 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cTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGt > 1:49919/1‑300 (MQ=255) tttAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCAGTTGCCGCGCGAACATAACGCAATGGGTTACTGGCATAGtt > 2:302817/1‑300 (MQ=255) gACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTtttct > 1:501470/1‑300 (MQ=255) acccaacccaCCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGNTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACNGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTtttctt > 2:420296/1‑300 (MQ=255) acccaacccaCCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTtttctt > 1:581257/1‑300 (MQ=255) cccaacccaCCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTtttcttt < 2:349628/300‑1 (MQ=255) cccaCCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGCGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCAt > 1:32954/1‑300 (MQ=255) accaGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGc < 1:518237/300‑1 (MQ=255) cGTTCTTGGACACATTACCATTGAAAATAACATTGTAAATTTCGCTACCTTCCTGTCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCCCTGTTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGTAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGc < 2:117914/300‑1 (MQ=255) 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cATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCANTGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCNTGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTAccc < 2:595664/300‑1 (MQ=255) cATTGAAAATAACATGGTAAACTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATTGCTCGCTGTGATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGNTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCCCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTTGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTAccc < 2:143936/300‑1 (MQ=255) aTAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCg < 1:3992/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |