| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 7 (0.070) | 7/598 | 6.9 | 4.4% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4525320 | 151 (1.550) | coding (484/789 nt) | yjhI | putative DNA‑binding transcriptional regulator YjhI | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CTTTTCGTAAGTGCTCATTTTCGTTTCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGTGAAT > NC_000913/4525023‑4525619 | tttCGTAAGTGCTCATTTTCGTTTCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTg < 1:657207/300‑1 (MQ=255) gTGCTCATTTTCGTTTCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAGTAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTc < 1:454122/300‑1 (MQ=255) tCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATTGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCGTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTaaggaaggtgcgaacaagtccctgatatg < 2:202045/300‑28 (MQ=255) tCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTaaggaaggtgcgaacaagtccctgatatg > 1:550270/1‑273 (MQ=255) gTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGttc > 1:432442/1‑300 (MQ=255) aTCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCACGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGttctt > 1:59488/1‑300 (MQ=255) ccAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTtctc < 2:621473/300‑1 (MQ=255) ccAGCCCATATAATATTTGCTCAGCGCATTTCCGTAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTtctc < 2:231082/300‑1 (MQ=255) gccaatatGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAAGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCgtg < 2:117111/296‑1 (MQ=255) tatTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGc > 1:724359/1‑300 (MQ=255) atTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCt < 1:18378/300‑1 (MQ=255) atTTACTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCt < 2:92468/300‑1 (MQ=255) cTCAGCGCATTTCCTGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGANGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAANCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCATGCtaataa < 2:523145/300‑1 (MQ=255) cTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCtaataa < 1:707675/300‑1 (MQ=255) tcgcgtttCCGGAGCAGTTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTGGGATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGcc < 2:401673/295‑1 (MQ=255) gcgcATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGcc < 2:239613/300‑1 (MQ=255) cgcATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCCCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTATTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCt < 2:333538/300‑1 (MQ=255) ttCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCNGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTAccc < 2:647757/300‑1 (MQ=255) ttCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTAccc < 1:603552/300‑1 (MQ=255) aTTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAANTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAANATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTaa < 2:684844/300‑1 (MQ=255) ccAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAatat < 1:456251/300‑1 (MQ=255) ccAGATAGCTGTCTATCTGATTTCCTGAATAAACTACCGGGTCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAatat < 2:633219/300‑1 (MQ=255) aGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCTCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGc < 1:379758/300‑1 (MQ=255) aGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGACTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGc < 1:734943/300‑1 (MQ=255) gagggcTATCGTATGTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCTTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTc < 2:383507/295‑1 (MQ=255) 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aTAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCt < 1:29354/300‑1 (MQ=255) cAGAAATTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGTTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTCCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAACTTTTGCTCGTCGGTACag < 2:259050/300‑1 (MQ=255) cAGAAATTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACag < 2:306077/300‑1 (MQ=255) cAGAAATTGAGATTGCAGAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACag < 2:88431/300‑1 (MQ=255) cAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCTATAGTTTGATTCTTCGTTGCCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACag < 1:327149/300‑1 (MQ=255) cAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACag < 2:69742/300‑1 (MQ=255) 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agaTTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGAc < 1:257962/300‑1 (MQ=255) gTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCtt > 2:568632/1‑300 (MQ=255) ctGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCgaga > 1:150709/1‑300 (MQ=255) 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gTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGt > 1:415906/1‑300 (MQ=255) gTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCAAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGt > 2:724704/1‑300 (MQ=255) aaCGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGTGaa > 2:452572/1‑300 (MQ=255) | CTTTTCGTAAGTGCTCATTTTCGTTTCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGTGAAT > NC_000913/4525023‑4525619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |