| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,397,239 | Δ10,478 bp | IS5‑mediated | ynaJ–[dgcM] | ynaJ, uspE, fnr, ogt, abgT, abgB, abgA, abgR, mcaS, smrA, [dgcM] |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1397238 | NA (NA) | 106 (1.090) | 74/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
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CGCTGATAATTTGCCGAGCGACTGGCTTTTAAACCCAGCGTTGCCGGCGCTTCGATACCTTCGAAAATAATCACCGGTTCTGTTTCTGTCAGCTTTCGCAAAACAAGCCGACAGCTCAATGCTGTTTCCTCTTCTTTACGCTGAACAGTGAGGATTTCGATAATATCGTGTTGGTTTTGCAGATCGGAGAGGTATTTCGGCAGTTCTTTTTGTGAGGAGACGGAATAGGGTCCGGTTCGTAGCTGACTAAACGTGAGGTCTTGCATCAACAGTTTCGCCGCGCTATTGGCATAAATTAACTGTTCCTCAAAGGGCGAAACGATCCAGACAGGACTGGTGAGTAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGAATTTTATTAATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCT > NC_000913/1407422‑1408014 | catttcgcatcatcaatcgacagttcggcttcgtgaaagccagatacaaggggttgctgaaaaacgataaccaactggcgatgttattcacgctggccaacctgtttcgggcggaccaaatgatacgtcagggggagagatctcactaaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaattaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAc < 1:668371‑M2/5‑1 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CGCTGATAATTTGCCGAGCGACTGGCTTTTAAACCCAGCGTTGCCGGCGCTTCGATACCTTCGAAAATAATCACCGGTTCTGTTTCTGTCAGCTTTCGCAAAACAAGCCGACAGCTCAATGCTGTTTCCTCTTCTTTACGCTGAACAGTGAGGATTTCGATAATATCGTGTTGGTTTTGCAGATCGGAGAGGTATTTCGGCAGTTCTTTTTGTGAGGAGACGGAATAGGGTCCGGTTCGTAGCTGACTAAACGTGAGGTCTTGCATCAACAGTTTCGCCGCGCTATTGGCATAAATTAACTGTTCCTCAAAGGGCGAAACGATCCAGACAGGACTGGTGAGTAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGAATTTTATTAATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCT > NC_000913/1407422‑1408014 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |