| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,909,163 | IS2 (–) +5 bp | [yobH] | [yobH] | |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1909167 | 0 (0.000) | 82 (0.840) | 58/598 | 0.4 | 100% | intergenic (+3/+141) | yobH/kdgR | uncharacterized protein YobH/DNA‑binding transcriptional repressor KdgR |
| ? | NC_000913 | 2068941 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAATATAACGCCACCTTCAACTTTATTTTTCTCATGCTAAATAAAGAACCTGTCTGTTTGATATTCCGACAGGTTCTTACTCTCATCAGAACGGATAGTCGTGATAACCCATTTGGGCAGAAATTTTGCGCGCTGCGGTATGCAACATTGCGACATATTCCTGTAAACGCTCTTCAGAGAAACGCAACGTCGGGAAGGAGATGCTCAAACCGGCAATGACCACGCCAAAGCGATCA > NC_000913/1908867‑1909458 | gaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccatagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAgg > 2:216953‑M1/297‑300 (MQ=255)gaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattgagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAgg > 1:435471‑M1/297‑300 (MQ=255)gaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAgg > 1:697575‑M1/297‑300 (MQ=255) gATTAAGCGAACCTAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGtggatttgcccctatatttccaga > 1:389611‑M1/1‑276 (MQ=255) 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TTGCTTCAGCGCATATTGCCGCTACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGTAATGCGATTCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAATATAACGCCACCTTCAACTTTATTTTTCTCATGCTAAATAAAGAACCTGTCTGTTTGATATTCCGACAGGTTCTTACTCTCATCAGAACGGATAGTCGTGATAACCCATTTGGGCAGAAATTTTGCGCGCTGCGGTATGCAACATTGCGACATATTCCTGTAAACGCTCTTCAGAGAAACGCAACGTCGGGAAGGAGATGCTCAAACCGGCAATGACCACGCCAAAGCGATCA > NC_000913/1908867‑1909458 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |