| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,367,069 | IS2 (+) +5 bp | coding (144‑148/717 nt) | yhcF → | DUF1120 domain‑containing protein YhcF |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 129 (1.330) | 76/596 | 0.1 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3367069 = | 0 (0.000) | coding (144/717 nt) | yhcF | DUF1120 domain‑containing protein YhcF | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186392‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAAGTTAACAACTCCGCCGTTGCTTAGTATTGGAGTACAAGCTGCAGCTTCCAGAGTCACCTTAACGTCAATTGATACTCTATCAGCGGCTTGCGCTGACATGGCAAAAAAGGCACTTCCGGCAATCAGTAATTTTACATTGTTCATTTTGCCTCCACCAGGACCGTCAGATTGCCTGTAATATCTGTCATGTCGGTTAGTTCCCCTTCATCCTTAAAAGCTGGAGCCATTGTCAGTGTGAGGCTAACGCTTTTACCGCTATCAATTACCACTTCTTGACCATTTTGCATAAACACCA < NC_000913/3367073‑3366775 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTAAACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCACGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGA > 1:378489/1‑300 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GATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGAAGTTAACAACTCCGCCGTTGCTTAGTATTGGAGTACAAGCTGCAGCTTCCAGAGTCACCTTAACGTCAATTGATACTCTATCAGCGGCTTGCGCTGACATGGCAAAAAAGGCACTTCCGGCAATCAGTAATTTTACATTGTTCATTTTGCCTCCACCAGGACCGTCAGATTGCCTGTAATATCTGTCATGTCGGTTAGTTCCCCTTCATCCTTAAAAGCTGGAGCCATTGTCAGTGTGAGGCTAACGCTTTTACCGCTATC > 2:673241/1‑300 GTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGAAGTTAACAACTCCGCCGTTGCTTAGTATTGGAGTACAAGCTGCAGCTTCCAGAGTCACCTTAACGTCAATTGATACNCTATCAGCGGCTTGCGCTGACATGGCAAAAAAGGCACTTCCGCCAATCAGTAATTTTACATTGTTCATTTTGCCTCCACCAGGACCGTCAGATTGCCTGTAATATCTGTCATGTCGGTTAGTTCCCCTTCATCCTTAAAAGCTGGAGCCATTGTCAGTGTGAGGCTAACGCTTTTACCGCTATCAATTACCACT < 2:644861/300‑1 CAGGGGGCCAGTCTACGAAGTTAACAACTCCGCCGTTGCTTAGTATTGGAGTACAAGCTGCAGCTTCCAGAGTCACCTTAACGTCAATTGATACTCTATCAGCGGCTTGCGCTGACATGGCAAAAAAGGCACTTCCGGCAATCAGTAATTTTACATTGTTCATTTTGCCTCCACCAGGACCGTCAGATTGCCTGTAATATCTGTCATGTCGGTTAGTTCCCCTTCATCCTTAAAAGCTGGAGCCATTGTCAGTGTGAGGCTAACGCTTTTACCGCTATCAATTACCACTTCTTGACCATT > 1:190978/1‑300 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GTCTACGAAGTTAACAACTCCGCCGTTGCTTAGTATTGGAGTACAAGCTGCAGCTTCCAGAGTCACCTTAACGTCAATTGATACTCTATCAGCGGCTTGCGCTGACATGGCAAAAAAGGCACTTCCGGCAATCAGTAATTTTACATTGTTCATTTTGCCTACACCAGGACCGTCAGATTGCCTGTAATATCTGTCATGTCGGTTAGTTCCCCTTCATCCTTAAAAGCTGGAGCAGTTGTCAGTGTGAGGCTAACGCTTTTACCGCTATCAATTACCACTTCTTGACCATTTTGCATAAAC > 2:59966/1‑300 CTACGAAGTTAACAACTCCGCCGTTGCTTAGTATTGGAGTACAAGCTGCAGCTTCCAGAGTCACCTTAACGTCAATTGATACTCTATCAGCGGCTTGCGCTGACATGGCAAAAAAGGCACTTCCGGCAATCAGTAATTTTACATTGTTCATTTTGCCTCCACCAGGACCGTCAGATTGCCTGTAATATCTGTCATGTCGGTTAGTTCCCCTTCATCCTTAAAAGCTGGAGCCATTGTCAGTGTGAGGCTAACGCTTTTACCGCTATCAATTACCACTTCTTGACCATTTTGCATAAACAC < 1:107793/300‑1 ACGAAGTTAACAACTCCGCCGTTGCTTAGTATTGGAGTACAAGCTGCAGCTTCCAGAGTCACCTTAACGTCAATTGATACTCTATCAGCGGCTTGCGCTGACATGGCAAAAAAGGCACTTCCGGCAATCAGTAATTTTACATTGTTCATTTTGCCTCCACCAGGACCGTCAGATTGCCTGTAATATCTGTCATGTCGGTTAGTTCCCCTTCATCCTTAAAAGCTGGAGCCATTGTCAGTGTGAGGCTAACGCTTTTACCGCTATCAATTACCACTTCTTGACCATTTTGCATAAACACCA > 1:735186/1‑300 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186392‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAAGTTAACAACTCCGCCGTTGCTTAGTATTGGAGTACAAGCTGCAGCTTCCAGAGTCACCTTAACGTCAATTGATACTCTATCAGCGGCTTGCGCTGACATGGCAAAAAAGGCACTTCCGGCAATCAGTAATTTTACATTGTTCATTTTGCCTCCACCAGGACCGTCAGATTGCCTGTAATATCTGTCATGTCGGTTAGTTCCCCTTCATCCTTAAAAGCTGGAGCCATTGTCAGTGTGAGGCTAACGCTTTTACCGCTATCAATTACCACTTCTTGACCATTTTGCATAAACACCA < NC_000913/3367073‑3366775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |