| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,317,455 | IS2 (–) +5 bp | coding (2418‑2422/2850 nt) | rcsC ← | histidine kinase RcsC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2068941 = | NA (NA) | 73 (0.750) | 54/596 | 0.5 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2317459 | 0 (0.000) | coding (2418/2850 nt) | rcsC | histidine kinase RcsC | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2317455 = | 2 (0.020) | 81 (0.830) | 59/598 | 0.3 | 97.5% | coding (2422/2850 nt) | rcsC | histidine kinase RcsC |
| ? | NC_000913 | = 2997691 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
AACACGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2069237‑2068941‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATGGTTACCGCTTGACGCAACGCATTCGTCAGTTGGGACTGACGTTGCCGGTAATCGGAGTAACTGCT < NC_000913/2317459‑2317165 AACACGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGA < 2:573411/300‑1 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CTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGAC < 1:650785/300‑1 GAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCANAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGNGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAG > 2:593179/1‑300 CACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCCAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTACGTGCTAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTATGCCGTCAACGGCCAAAGCAGTCAGCGA > 2:129741/1‑300 ACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGAT < 1:331974/300‑1 CGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTAAATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATA > 2:156509/1‑300 GTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGAC > 2:480477/1‑300 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catAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGC < 2:571806/297‑1 CAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGCATTGCATCCGCATAGTTCGCTGGGGTAGCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGGTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGTGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCAGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGC < 2:674359/300‑1 GGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAA > 2:481213/1‑300 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TTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGTGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACAGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAA > 1:92687/1‑300 ACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATC < 1:127525/300‑1 GGCATCNGCATAGTGCGCTTGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCNGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCGAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTG < 2:608279/300‑1 CATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGAT > 1:280143/1‑300 CATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGAT > 2:37092/1‑300 CATCCGCATAGTGCGCTGGGCTATCGCTCGCCACGGGAATATCTACGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTAGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCACTGTAAAACCGCGAACGATGGCGTCACTGCGCTTACTACACTTAGCAAAAATCAcatcaac > 2:291488/1‑293 TCCGCATAGTGTGCTTGGTTATCACTCGCCACGGGAATAGCGGGGACAGCGGGTTGGTAATGGGTTAAGCGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGACAAAGCCACGATCATGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAACGGCCAGCGATAATCACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGAATCGTTGGGCTATCAATTTAAAACCGCGAATGACGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATAT < 2:44945/300‑1 TCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATAT < 1:375093/300‑1 GCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGNGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGNTATCGT > 2:609529/1‑300 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GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCACATTGATATCGTGCTTAGCGACGT > 2:154086/1‑300 atGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGGTGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATAT < 2:276630/298‑1 GGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGGTATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGNGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGAGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGG > 2:164826/1‑300 AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATG < 1:603994/300‑1 GGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATGGTTACCGCT < 1:240811/300‑1 GGCTTGTAATGGGTTACGTGCTAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCACCGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGTAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTACTGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAAAATGCCAAATATGGATGGTTACCGCTTGACGCA > 2:410007/1‑300 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GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATGGTTACCGCTTGACGCAACGCA > 2:415128/1‑300 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATGGTTACCGCTTGACGCAACGCATTCGT > 2:428393/1‑300 GGTTAATTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATGGTTACCGCTTGACGCAACGCATTCGTC < 1:739727/300‑1 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GAAATATAGGGGCAAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGAATGGTTCCCGCTTGCCGCAACGCATTCGTCAGTTGGGACTGACGTTGCCGGTA > 2:307418/1‑300 AAATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTTGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATGGTTACCGCTTGACGCAACGCATTCGTCAGTTGGGACTGACGTTGCCGGTAATCGGAGTAACTG < 1:130365/300‑1 ATCCACGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATGGTTACCGCTTGACGCAACGCATTCGTCAGTTGGGACTGACGTTGCCGGTAATCGGAGTACCTGCT > 2:623804/1‑300 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NC_000913/2069237‑2068941‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCGATCCTGCTAACGCTCTGCCGTCAACGGACAAAGCGGTCAGCGATAATGACGATATGATGATTCTGGTCGTGGATGATCATCCGATTAACCGGCGTTTGCTGGCAGATCAGTTGGGATCGTTGGGCTATCAATGTAAAACCGCGAATGATGGCGTCGATGCGCTTAATGTACTTAGCAAGAATCATATTGATATCGTGCTTAGCGACGTCAACATGCCAAATATGGATGGTTACCGCTTGACGCAACGCATTCGTCAGTTGGGACTGACGTTGCCGGTAATCGGAGTAACTGCT < NC_000913/2317459‑2317165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |