| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,596,299 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑3857/+2314) | hipB ← / ← lsrK | antitoxin/DNA‑binding transcriptional repressor HipB/autoinducer‑2 kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 102 (1.000) | 72/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1596303 | 0 (0.000) | intergenic (‑3861/+2314) | hipB/lsrK | antitoxin/DNA‑binding transcriptional repressor HipB/autoinducer‑2 kinase | |||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
GTCACCTGTAATCAGCATATCGACCTGGTAGCCGGCATCACTGTTATTGGTATGATTAAAGACAAAAACGCCTTCGCCAAGACCAAACTCCACTTTCGTCGCATTGGTGATAAATCCGGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTAT > NC_000913/1596005‑1596600 | ccTGTAATCAGCATATCGACCTGTTAGCCGGCATCACTGTTATTGGTATGATTAAAGACAAAAACGCCTTCGCCAAGACCAAACTCCACTTTCGTCGCATTGGTGATAAATCCGGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCtagac > 1:646713‑M2/1‑295 (MQ=255) 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GTCACCTGTAATCAGCATATCGACCTGGTAGCCGGCATCACTGTTATTGGTATGATTAAAGACAAAAACGCCTTCGCCAAGACCAAACTCCACTTTCGTCGCATTGGTGATAAATCCGGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTAT > NC_000913/1596005‑1596600 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |