| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,056,115 | 0 | A | C | 31.5% | 83.2 / 12.5 | 55 | G75G (GGT→GGG) | glnL | protein histidine kinase NtrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/6); new base C (0/17); total (31/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.14e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGCTGAGCAGCTGCGCCGCGCCACGTAAACCGCCAAGCGGATTTTTAATCTCATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTGCCTGTTGCCATAAAGCAGTCTCCTGAACAGGTTGC > NC_000913/4055871‑4056363 | ggctgagcatcgtcgccgcgccACGTAAACCGCCAAGCGGATTTTTAATCTCATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCCGT‑AAAACCTTGc < 2:143416/238‑1 (MQ=255) cgccgcgccACGTAAACCGCCAAGCGGATTTTTAATCTCATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGAc > 1:330829/1‑251 (MQ=255) cACGTAAACCGCCAAGCGGATTTTTAATCTCATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGc > 1:237292/1‑251 (MQ=255) ccAAGCGGATTTTTAATCTCATGTGCCGGCCCGCGCACAAAACCACGGGCAGCAACCTGTTGGGCGTGTTGGAGCTGTTCTTGATTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCACCAGCAGGATCTGGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGCCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGAGGACCAG‑CGGCATTTCTTTATGGGT‑AAAGCCTGGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGat < 1:60136/251‑1 (MQ=255) gCGGATTTTTAATCTCATGGGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGTTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCTTTATCGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATAttt < 1:118052/251‑1 (MQ=255) aTTTTTAATCTCATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATg > 1:74014/1‑251 (MQ=255) tttAATCTCATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATg > 1:448314/1‑248 (MQ=255) tctcATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGt > 2:391326/1‑249 (MQ=255) tcATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGAATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCt > 2:265885/1‑251 (MQ=255) cATGTGCAGGGCCGCGCACAAAACCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTGGCTGTTCCGGACTTAAGCGGCGGTGGTTATCCATGGGACCCATCCCCAGCAGGACCATGCCGCCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAAAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATAACCAG‑CGTCACTTTGTTATCGTT‑AAACCCGTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTa < 1:375987/247‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAAc > 2:221979/1‑249 (MQ=255) ccAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGt > 2:249773/1‑251 (MQ=255) aGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTc > 1:10957/1‑251 (MQ=255) cgcgCACTAAATCCGGGGCAGCAACCGGCTGGGCGTGCTGTAGCGTTTCCTGATTTAGGCGGCGCGGGTTACCCATCGGAGCCATCCCCAGCAGGATCAGGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGGGAGCGCCGGTCGATGCCCAG‑CGTCCCTTCGTTATCGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGt < 1:130913/251‑1 (MQ=255) gcgcACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTa < 2:237292/251‑1 (MQ=255) caaaaccACGGGCAGCACCCGGTGGGGCGTGCTGTGTCGGTTCCTGACTTAAGCGCCGCTGGTTATCCACCGGACCCTTCTCCAGCAGGACCAGGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAAAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCCCTTCTTTATCGGT‑AAACCCTTCCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGgt < 1:179531/245‑1 (MQ=255) cTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGgt > 1:441809/1‑251 (MQ=255) aCGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCa > 1:385127/1‑250 (MQ=255) gcaACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAAttt > 1:202657/1‑251 (MQ=255) cccTGCGGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTACCCAGCGGGGCCATCCCCAGCAGGATCAGGCCGCCCGGCATACGCTGGGCCGTCAAAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCCCTTCTTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCg < 1:7677/250‑1 (MQ=255) ccTGCGGGGCGTGCTGTAGCGGTCCCTGATTAAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCCCCAGCAGGATCATGCCGCCCGGCATCCGCTGGGCCGTCACAAAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCTTTATCGGA‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCgg < 1:254255/251‑1 (MQ=255) ggcggggCGTGCTGTAGCTTTTCCTGACTAAAGCGGCGCTTGTTATCCAGCGGAGCCATCTCAAGCAGGATCAGCCCGTCCGGCATACGCGGGGCCGTCACAAAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCGG‑CCTCTCTTCGTTATCGGA‑AAACCCGTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGa < 2:160209/247‑1 (MQ=255) gggCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGCTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCtt > 2:136818/1‑251 (MQ=255) ggCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCACACAATTTGCGGGAGCttt > 2:355423/1‑251 (MQ=255) aGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGc > 2:344998/1‑249 (MQ=255) gcggcgTTGGTTATCCACCGGAGCCTTCTCCAGCAGGATCATGCCGCCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAAAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAACCCTTCCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGt < 1:161380/251‑1 (MQ=255) cTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCCGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCGGTGGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGt > 1:150783/1‑251 (MQ=255) gAGCCATCTCCAGCAGGACCATGCCGTCCGGCATACGCGGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGCCCAG‑CGTCCCTTCGTTATCGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAgg < 1:416476/251‑1 (MQ=255) aGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCTGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGt > 1:145339/1‑251 (MQ=255) ccATCCCCAGCGGGATCAGGCCGTCCGGCATACGCGGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGAGGACCGG‑CGTCCCTTCGTTAGCGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTg < 1:216497/251‑1 (MQ=255) tctcCAGCAGAATGATGCCGGCCGGCAGACGCTGGGCCGTCACCGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑GAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTCGCTCAACAGTTCCGGTAACGTTTTACCAAACAATTTACGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGATGCTCGGCAGGGTTGACGTAAGGAATCGCCAggctatcc > 2:124474/1‑245 (MQ=255) ccagaatgttcaggccgccCGGAATACGCTGGCCCGCCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGCCCGG‑CTTCATTTCGTTATCGG‑‑AAAACCCTGCCCCCGCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCg < 2:441809/238‑1 (MQ=255) agcagGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGAGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCAATTCGTTATCGGA‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGCTATTTAATGAGCAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGAt > 1:233768/1‑251 (MQ=255) ggATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCCCCCGTCGATGCCCAG‑CGTCTTTTCGTTCTCGGT‑AAAACCTTCCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAAc < 1:257397/251‑1 (MQ=255) ggATCATGCCGCCCGTCATGCGTTGGGCCGTAACAGAAAGGTTATGCGGGCGCCCGTCGA‑GGCCAGGCGTCCTTTCGTTATGGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGCTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAAc < 2:404331/251‑1 (MQ=255) tCATCCCGTCCGGCATACGCGGGCCCGTCACAGAAAGGATAGGCGAGCGCCCGTCGATGACCGG‑CTTCACTTC‑TTTTGGGTTAAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACaa < 2:299963/250‑1 (MQ=255) cGGCATACGCTGGGCCGTCACAGCAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTa > 2:190009/1‑250 (MQ=255) cGGCATACGCTGGGCCGTCAAAAAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGCCAAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCTCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTaa < 1:301344/251‑1 (MQ=255) cATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATc > 2:186168/1‑250 (MQ=255) gcgcggggCCGTCACAAAAAGGATATGGGCGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCTCTTCGTTATCGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCg < 2:230608/246‑1 (MQ=255) ccGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAgg > 2:120775/1‑251 (MQ=255) cctcaaaGAAAGGATAGGCGAGCCCCCTTCGATGCCCAG‑CTTCACTTCTTTATCAGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGa < 2:172871/245‑1 (MQ=255) tCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATc > 2:208951/1‑251 (MQ=255) caGAAAGGATATGCGAGAGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGc > 2:311604/1‑251 (MQ=255) aGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGc > 2:264612/1‑251 (MQ=255) atGCGAGCGCCCTTCGATGCCCCG‑CGTCACTTCGTTATGGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCgg < 1:243769/251‑1 (MQ=255) aggCGACCGCCCGTCGATGCCCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCg < 1:89318/248‑1 (MQ=255) cgcCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGt > 1:373645/1‑251 (MQ=255) cccggTCGAGGACAAG‑CGTCTCTTGTTTATCGTT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTGAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCGTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGTAGGGTTGGCGTAATGGGTCGCCAGGTTGTCTTCGATTAACAAAAGACTGTTGATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTg < 1:294525/247‑1 (MQ=255) ccccGTCGATGACCAG‑CGTCAATTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAAACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGAAGCTCACCATTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGAGGAATAGATCGCGAGGTTGTCATCGTTTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGCTCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTg > 2:379324/2‑251 (MQ=255) gTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTGCCTg > 2:451275/1‑251 (MQ=255) cGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTGCCTGtt > 2:47669/1‑251 (MQ=255) aG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGCCTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATAGATCGCCTGGATGTCATCGCTTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTGCCTGTTGCCATaa > 1:283332/1‑250 (MQ=255) ctcTTCGTTATCGTT‑AAACCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTGCCTGTTGCCATAAAGCa < 1:44383/247‑1 (MQ=255) cACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTGCCTGTTGCCATAAAGCAGt > 1:258150/1‑251 (MQ=255) aaaCCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTGCCTGTTGCCATAAAGCAGTCTCCTGAACAGGTTGc > 1:446740/1‑251 (MQ=255) | TGCTGAGCAGCTGCGCCGCGCCACGTAAACCGCCAAGCGGATTTTTAATCTCATGTGCCAGGCCGCGCACTAAATCACGGGCAGCAACCTGCTGGGCGTGCTGTAGCTGTTCCTGACTTAAGCGGCGCTGGTTATCCATCGGAGCCATCTCCAGCAGGATCATGCCGTCCGGCATACGCTGGGCCGTCACAGAAAGGATATGCGAGCGCCCGTCGATGACCAG‑CGTCACTTCGTTATCGGT‑AAAACCTTGCCCC‑GCCTCCAGACTTTCTTGCATCAGCTCGATATTTAATGAGAAGTAGCTCAACAGTTCCGGTAACGGTGTACCAAACAATTTGCGGGAGCTTTGGGCGAGCAGTTGTTGCGCGGCAGGGTTGGCGTAATGGATCGCCAGGTTGTCATCGATTAACAAAATACTGTTAATCAGCGAGTTGAGGATCTGCCCAGCATCGGGCTGCGTGCCTGTTGCCATAAAGCAGTCTCCTGAACAGGTTGC > NC_000913/4055871‑4056363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |