Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,128,813 | Δ2 bp | coding (142‑143/1161 nt) | metB → | O‑succinylhomoserine(thiol)‑lyase/O‑ succinylhomoserine lyase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,128,811 | 0 | C | . | 100.0% | 175.3 / NA | 38 | coding (140/1161 nt) | metB | O‑succinylhomoserine(thiol)‑lyase/O‑ succinylhomoserine lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (17/21); total (17/21) | |||||||||||
* | NC_000913 | 4,128,812 | 0 | G | . | 100.0% | 175.3 / NA | 38 | coding (141/1161 nt) | metB | O‑succinylhomoserine(thiol)‑lyase/O‑ succinylhomoserine lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (17/21); total (17/21) |
ACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACTCGCGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACA > NC_000913/4128571‑4129054 || aCGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGCAGTCCATTAACACAATGTTTCCTCTGGTGCCTGACATTTAACCGACACAGACCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCa > 1:276911/1‑250 (MQ=255) gCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCaccc > 2:102473/1‑248 (MQ=255) agaagTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGGCCATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAAc < 2:560/251‑1 (MQ=255) tCCATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGc > 2:153735/1‑249 (MQ=255) ccATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGa < 1:164147/251‑1 (MQ=255) ggTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGtggtgctggt < 2:205489/248‑1 (MQ=255) aCATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGtacttac < 2:51402/251‑1 (MQ=255) tCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAAt < 1:41298/250‑1 (MQ=255) aCCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATAcc > 2:229861/1‑251 (MQ=255) cataGCCCAGGGAACTTCATCACATGCCGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCTGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCAt < 2:155597/248‑1 (MQ=255) cAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCAt < 1:123420/251‑1 (MQ=255) aaaGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATg > 2:116199/1‑251 (MQ=255) aaaGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTCGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATg < 1:113330/251‑1 (MQ=255) cccAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCcg > 1:211833/1‑251 (MQ=255) cTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAACTGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCAcc > 2:136769/1‑251 (MQ=255) ccaTGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAAc < 1:208747/250‑1 (MQ=255) acaTGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGCGCGTAGAGGGATAACTGACGACGAACAGTATGGATGCGTTGTCCCACCGATCCATATTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAAc > 1:266451/1‑251 (MQ=255) gACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGtggtgctggtg < 1:50216/204‑1 (MQ=255) gACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGtggtgctggtg > 2:50216/1‑204 (MQ=255) ccaTCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTgg > 2:198946/1‑251 (MQ=255) gTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGGGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCAGGTCAGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATctgc > 2:145786/1‑251 (MQ=255) ggTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGcgcc < 1:134526/251‑1 (MQ=255) ttAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGcgccgc > 1:277321/1‑251 (MQ=255) tAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTCTAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGcgccgc > 1:277821/1‑250 (MQ=255) gaACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTAcg > 1:120650/1‑251 (MQ=255) tGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGGAGccttc > 1:213290/1‑247 (MQ=255) 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ccGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACa < 1:136769/251‑1 (MQ=255) gATCCATCTGTCCAGCACCTATAACTGTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGAGTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCGCGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGt < 1:44328/251‑1 (MQ=255) aGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAAcgcg < 2:231104/251‑1 (MQ=255) 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ACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACTCGCGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACA > NC_000913/4128571‑4129054 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |