| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 598,429 | C→T | L317L (CTC→CTT) | cusB → | copper/silver export system membrane fusion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 598,429 | 0 | C | T | 98.7% | 285.2 / NA | 79 | L317L (CTC→CTT) | cusB | copper/silver export system membrane fusion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (44/34); total (45/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGCGTTTGATCTGCGCGCGGGAATGAATATCGCCAAAGATAACGTGGTAGCGAAAATTCAGGGTATGGACCCGGTGTGGGTCACTGCTGCGATCCCGGAGTCTATCGCCTGGCTGGTGAAAGATGCCTCGCAGTTTACCCTCACCGTTCCGGCGCGACCGGATAAAACACTCACCATCCGCAAATGGACGCTGCTACCTGGCGTGGATGCCGCGACCCGCACGCTGCAGCTGCGTCTGGAAGTCGACAACGCCGACGAGGCGCTAAAACCGGGCATGAACGCCTGGTTGCAACTCAACACCGCCAGCGAACCGATGCTGCTCATTCCGTCACAAGCGCTGATTGATACCGGCAGCGAACAGCGGGTGATTACCGTTGATGCCGACGGGCGCTTTGTACCGAAACGCGTTGCTGTTTTCCAGGCATCGCAAGGCGTCACCGCATTACGCTCTGGTCTGGCGGAAGGTGAAAAGGTGGTTTCCAGCGGCCTGTTCCTGATTGATTCCGAAGCCAATATTTCTGGCGCACTGGAGCGGATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAAT > NC_000913/598135‑598723 | cgcgTTTGATCTGCGCGCGTGAATGAATATCGCCAAAGATAACGTGGTAGCGAAAATTCAGGGTATGGACCCGGTGTGGGTCACTGCTGCGATCCCGGAGTCTATCGCCTGGCTGGTGAAAGATGCCTCGCAGTTTACCCTCACCGTTCCGGCGCGACCGGATAAAACACTCACCATCCGCAAATGGACGCTGCTACCTGGCGTGGATGCCGCGACCCGCACGCTGCAGCTGCGTCTGGAAGTCGACAACGCCGACGAGGCGCTAAAACCGGGCATGAACGCCTGGTTGCAACTTAacac < 2:449338/300‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |