Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 246,747 | G→T | S12S (TCG→TCT) | yafL → | NlpC/P60 family protein YafL |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 246,747 | 0 | G | T | 99.1% | 382.2 / NA | 108 | S12S (TCG→TCT) | yafL | NlpC/P60 family protein YafL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (51/56); total (51/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTCTTCAGATCTTCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAGTAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATACACTGCAACATTAAAGCATGACCAGCCATTATTGAGTATGTCCTTGCCGTCGATTCCATCCTTTGTATTGTCGGGATTACTGTTGATTTGTTTGCCGTTTTCTTCATTTGCCAGCGCCACCACATCACATATCTCTTTCAGCTACGCCGCCCGCCAGCGGATGCAAAACCGTGCGCGTTTATTAAAACAGTACCAAACTCATCTGAAAAAGCAGGCCAGCTATATTGTGGAAGGCAATGCCGAAAGCAAAAGGGCGCTACGCCAGCACAACCGGGAGCAGATAAAACAGCATCCAGAATGGTTTCCTGCTCCGCTCAAGGCGAGTGACAGACGCTGGCAGGCGCTGGCGGAAAACAACCAC > NC_000913/246453‑247035 | cttcAGATCTTCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAGTAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATACACTGCAACATTAAAGCATGACAAGCCATTATTGAGTATGTCCTTGCCGTCGATTCCATCTTTTGTATTGTCTGGATTAc > 1:36253/1‑300 (MQ=255) 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aTTCCATCCTTTGTATTGTCTGGATTACTGTTGATTTGTTTGCCGTTTTCTTCATTTGCCAGCGCCACCACATCACATATCTCTTTCAGCTACGCCGCCCGCCAGCGGATGCAAAACCGTGCGCNTTTATTAAAACAGTACCAAACTCATCNGAAAAAGCAGGCCAGCTATATTGTGGAAGGCAATGCCGAAAGCAAGAGGGCGCTACGCCAGCACAACCGGGAGCAGATAAAACAGCATCCAGAATGGTTTCCTGCTCCGCTCAAGGCGAGTGACAGCCGCTGGCAGGCGCTGGCGGaa > 2:563924/1‑300 (MQ=255) ccATCCTTTGTATTGTCTGGATTATTGTTGATTTGTTTGCCGTTTTTTTCATTTGCCAGCGCCACCACATCACATATCTCTTTCAGCTACGCCGCCCGCCAGCGGATGCAAAACCGTGCGCGTTTATTAAAACAGTACCAAACTCATCTGAAAAAGCAGGCCAGCTATATTGTGGAAGGCAATGCCGAAAGCAAAAGGGCGCTACGCCAGCACAACCGGGAGCAGATAAAACAGCATCCAGAATGGTTTCCTGCTCCGCTCAAGGCGAGTGACAGACGCTGGCAGGCGCTGGCGGAAaac < 1:157181/300‑1 (MQ=255) tttGTATTGTCTGGATTACTGTTGATTTGTTTGCCGTTTTCTTCATTTGCCAGCGCCACCACATCACATATCTCTTTCAGCTACGCCGCCCGCCAGCGGATGCAAAACCGTGCGCGTTTATTAAAACAGTACCAAACTCATCTGAAAAAGCAGGCCAGCTATATTGTGGAAGGCAATGCCGAAAGCAAAAGGGCGCTACGCCAGCACAACCGGGAGCAGATAAAACAGCATCCAGAATGGTTTCCTGCTCCGCTCAAGGCGAGTGACAGACGCTGGCAGGTGCTGGCGGaaaataaacac > 2:238424/1‑293 (MQ=255) | TTCTTCAGATCTTCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAGTAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATACACTGCAACATTAAAGCATGACCAGCCATTATTGAGTATGTCCTTGCCGTCGATTCCATCCTTTGTATTGTCGGGATTACTGTTGATTTGTTTGCCGTTTTCTTCATTTGCCAGCGCCACCACATCACATATCTCTTTCAGCTACGCCGCCCGCCAGCGGATGCAAAACCGTGCGCGTTTATTAAAACAGTACCAAACTCATCTGAAAAAGCAGGCCAGCTATATTGTGGAAGGCAATGCCGAAAGCAAAAGGGCGCTACGCCAGCACAACCGGGAGCAGATAAAACAGCATCCAGAATGGTTTCCTGCTCCGCTCAAGGCGAGTGACAGACGCTGGCAGGCGCTGGCGGAAAACAACCAC > NC_000913/246453‑247035 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |