Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,950,110 | G→A | intergenic (‑141/‑212) | yifB ← / → ilvL | putative magnesium chelatase YifB/ilvXGMEDA operon leader peptide |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,950,110 | 0 | G | A | 98.9% | 669.2 / NA | 187 | intergenic (‑141/‑212) | yifB/ilvL | putative magnesium chelatase YifB/ilvXGMEDA operon leader peptide |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (115/70); minor base C (2/0); total (117/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.29e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
CTGCGCACGCGATCGCGAGCTTCTTTTACCGTTGTTTCTGGTAAGCCCACCATCGTTAAGCCGGGTAGACCTTTACTGATATGTACCTCAACAGTGATCGGGGGCGCATTTACTCCCAGGGCTGCGCGGGTATGAACAATTGACAGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAAAATATCTTGTACTATTTACAAAACCTATGGTAACTCTTTAGGCATTCCTTCGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGA > NC_000913/3949818‑3950405 | cTGCGCACGCGATCGCGAGCTTCTTTTACCGTTGTTTCTGGTAAGCCCACCATCGTTAAGCCGGGTAGACCTTTACTGATATGTACCTCAACAGTGATCGGGGGCGCATTTACTCCCAGGGCTGCGCGGGTATGAACAATTGACAGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATACAGCGGa > 1:89539/1‑300 (MQ=255) 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atgCTCGCAAAAATACAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAAAATATCTTGTACTATTTACAAAACCTATGGTAACTCTTTAGGCATTCCTTCGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGc < 2:762584/300‑1 (MQ=255) atacTCGCAAAAATACAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATNTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAAAATATCTTGTACTATTTACAAAACCTATGGTAACTCTTTAGGCATTCCTTCGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGc < 1:609122/297‑1 (MQ=255) cGCAAAAATACAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAAAATATCTTGTACTATTTACAAAACCTATGGTAACTCTTTAGGCATTCCTTCGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCAc < 2:108085/300‑1 (MQ=255) cGCAAAAATACAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATGCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAAAATATCTTGTACTATTTACAAAACCTATGGTAACTCTTTAGGCATTCCTTCGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCAc < 1:296232/300‑1 (MQ=255) aaaTACAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAAAATATCTTGTACTATTTACAAAACCTATGGTAACTCTTTAGGCATTCCTTCGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGa < 2:91005/300‑1 (MQ=255) aaaTACAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATCTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAAAATATCTTGTACTATTTACAAAACCTATGGTAACTCTTTAGGCATTCCTTCGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGa < 2:516470/300‑1 (MQ=255) | CTGCGCACGCGATCGCGAGCTTCTTTTACCGTTGTTTCTGGTAAGCCCACCATCGTTAAGCCGGGTAGACCTTTACTGATATGTACCTCAACAGTGATCGGGGGCGCATTTACTCCCAGGGCTGCGCGGGTATGAACAATTGACAGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAAAATATCTTGTACTATTTACAAAACCTATGGTAACTCTTTAGGCATTCCTTCGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGA > NC_000913/3949818‑3950405 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |