| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,935,468 | G→A | V61I (GTC→ATC) | rbsC → | ribose ABC transporter membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,935,468 | 0 | G | A | 98.9% | 318.9 / NA | 91 | V61I (GTC→ATC) | rbsC | ribose ABC transporter membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (39/51); total (39/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTCATGCATGAAGGGCATCTCAGCGGGGAATTTACTCGTGAGCAGGCCACCCAGGAAGTGTTAATGGCTGCCGCTGTGGGCAAGCTTAATCGCGTGAATCAGGAGTAAAAAAATGACAACCCAGACTGTCTCTGGTCGCCGTTATTTCACGAAAGCGTGGCTGATGGAGCAGAAATCGCTTATCGCTCTGCTGGTGCTGATCGCGATTGTCTCGACGTTAAGCCCGAACTTTTTCACCATCAATAACTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTATGATGCTTTTACTGCGCGGCGTGACCATGGTTTATACCAACGGTAGCCCAGTGAATACCGGCTTTACTGAGAAC > NC_000913/3935176‑3935758 | gTCATGCATGAAGGGCATCTCAGCGGGGAATTTACTCGTGAGCAGGCCACCCAGGAAGTGTTAATGGCTGCCGCTGTGGGCAAGCTTAATCGCGTGAATCAGGAGTAAAAAAATGACAACCCAGACTGTCTCTGGTCGCCGTTGTTTCACGAAAGCGTGGCTGATGGAGCAGAAATCGCTTATCGCTCTGCTGGTGCTGATCGCGATTGTCTCGACGTTAAGCCCGAACTTTTTCAACATCAATAACTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTAAGTGAACGCCATTATGGCGATCGGGAt > 2:406915/1‑300 (MQ=255) gcatgAAGGGCATCTCAGCGGTGAATTTACTCGTGAGCAGGCCACCCAGGAAGTGTTAATGGCTGCCGCTGTGGGCAAGCTTAATCGCGTGAATCAGGAGTAAAAAAATGACAACCCAGACTGTCTCTGGTCGCCGTTATTTCACGAAAGCGTGGCTGATGGAGCAGAAATCGCTTATCGCTCTGCTGGTGCTGATCGCGATTGTCTCGACGTTAAGCCCGAACTTTTTCACCATCAATAACTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGATCGGGATGACGc < 1:756768/300‑1 (MQ=255) gcatgAAGGGCATCTCAGCGGGGAATTTACTCGTGAGCAGGCCACCCAGGAAGTGTTAATGGCGGCCGCTGTGGGCAAGCTTAATCGCGTGAATCAGGAGTAAAAAAATGACAACCCAGACTGTCTCTGGTCGCCGTTATTTCACGAAAGCGTGGCTGATGGAGCAGAAATCGCTTATCGCTCTGCTGGTGCTGATCGCGATTGTCTCGACGTTAAGCCCGAACTTTTTCACCATCAATAACTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGATCGGGATGACGc < 1:190450/300‑1 (MQ=255) gcatgAAGGGCAGCTCAGCGGGGAATTTACTCGTGAGCAGGCCACCCAGGAAGTGTTAATGGCTGCCGCTGTGGGCAAGCTTAATCGCGTGAATCAGGAGTAAAAAAATGACAACCCAGACTGTCTCTGGTCGCCGTTATTTCACGAAAGCGTGGCTGATGGAGCAGAAATCGCTTATCGCTCTGCTGGTGCTGATCGCGATTGTCTCGACGTTAAGCCCGAACTTTTTCACCATCAATAACTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGATCGGGATGACGc < 2:722051/300‑1 (MQ=255) 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aaGGGCATCTCAGCGGGGAATTTACTCGTGAGCATGCCACCCAGGAAGTGTTAATGGCTGCCGCTGTGGGCAAGCTTAATCGCGTGAATCAGGAGTAAAAAAATGACAACCCAGACTGTCTCTGGTCGCCGTTATTTCACGAAAGCGTGGCTGATGGAGCAGAAATCGCTTATCGCTCTGCTGGTGCTGATCGCGATTGTCTCGACGTTAAGCCCGAACTTTTTCACCATCAATAACTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGATCGGGATGACGCTGGTg < 1:388722/300‑1 (MQ=255) aaGGGCATCTCAGCGGGGAATTTACTCGTGAGCAGGCCACCCAGTAAGTGTTAATGGCTGCCGCTGTGGGCAAGCTTAATCGCGTGAATCAGGAGTAAAAAAATGACAACCCAGACTGTCTCTGGTCGCCGTTATTTCACGAAAGCGTGGCTGATGGAGCAGAAATCGCTTATCGCTCTGCTGGTGCTGATCGCGATTGTCTCGACTTTAAGCCCGAACTTTTTCACCATCAATAACTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGATCGGGATGACGCTGGTg < 1:202772/300‑1 (MQ=255) aaGGGCATCTCAGCGGGGAATTTACTCGTGAGCAGGCCACCCAGGAAGTGTTAATGGCTGCCGCTGTGGGCAAGCTTAATCGCGTGAATCAGGAGTAAAAAAATGACAACCCAGACTGTCTCTGGTCGCCGTTATTTCACGAAAGCGTGGCTGATGGAGCAGAAATCGCTTATCGCTCTGCTGGTGCTGATCGCGATTGTCTCGACGTTAAGCCCGAACTTTTTCACCATCAATAACTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGATCGGGATGACGCTGGTg < 1:388714/300‑1 (MQ=255) 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