Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,501,192 | C→T | P207L (CCT→CTT) | tehA → | tellurite resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,501,192 | 0 | C | T | 98.8% | 288.7 / NA | 80 | P207L (CCT→CTT) | tehA | tellurite resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (50/29); minor base G (0/1); total (50/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCAGTTTTGGTGTCGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTGCAATACTGCTC > NC_000913/1500898‑1501478 | tCAGTTTTGGTGTCTTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTgcgc < 2:7018/300‑1 (MQ=255) tCAGTTTTGGTGTCGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACNGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTgcgc < 1:609220/300‑1 (MQ=255) tGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTg < 1:243405/300‑1 (MQ=255) tCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCAGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTg > 2:111960/1‑300 (MQ=255) gtttGGCTTATGCCTCCTGGCAAACTGCTGGATTAGTGCGCGGATCTCACCCTGAATAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTTTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGTTGGCTTGTAGTGCCTGGc < 2:159345/298‑1 (MQ=255) aGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGc < 1:22928/300‑1 (MQ=255) ggCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTCCCACGCCCGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCAGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACCTCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAg > 1:546842/1‑300 (MQ=255) cTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTg > 2:5214/1‑300 (MQ=255) gggATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACNCCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGacac < 1:617188/300‑1 (MQ=255) gaagaaGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCNGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCAGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTNATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTATGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCATGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTAt > 2:588056/1‑300 (MQ=255) 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tCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCt < 1:185349/300‑1 (MQ=255) gCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACg > 1:367924/1‑300 (MQ=255) ctgcgagatgtgtataagagacaggcAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGTTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTg > 1:660432/25‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |