| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2817783 = | 117 (1.090) | 3 (0.030) | 3/558 | 10.0 | 3.1% | intergenic (‑280/+1) | yqaB/argQ | fructose‑1‑phosphate phosphatase YqaB/tRNA‑Arg |
| ? | NC_000913 | = 2817922 | 76 (0.760) | intergenic (‑62/+137) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTTTTGAAGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGA > NC_000913/2817623‑2818219 | atTTTTGAAGGAAATTTTTTTGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTGCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAagag < 2:273385/300‑1 (MQ=255)atTTTTGAAGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGTGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCTGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAagag < 1:159921/300‑1 (MQ=255)atTTTTGAAGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCAGGGAGGGTGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTACTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTACATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAagag < 2:51137/300‑1 (MQ=255) aaGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCGGGGGCCGGCGGTTAATANCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGTAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATC‑AGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAA‑CTTACTTTACTGCAGATTTTTTGA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCGTATC‑AAGTAAGAGATGGTGc < 1:574621/300‑1 (MQ=18) aGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAA‑TTTATTTTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AAGTAAGAGATGGTGCAt < 1:214000/300‑1 (MQ=255) ttttGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGNCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTNCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGggag < 2:791019/300‑1 (MQ=255) tttGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGTGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGggagg < 2:240116/300‑1 (MQ=255) 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aTGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGcc < 1:519334/300‑1 (MQ=255) gCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAGCGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCTTTCTATTACCCCCGCTCCCCATTAGATACCCCCATTGCTCTACATCCCAGCGGCCATGCTTCCCCCTATCGGCTTCCAACCTCTGACCACTCGGTTAGTAGCCGAGTAGTATATCAGGCTGAGCTAAGGATGCATCGGGAAAAGTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GG‑GACCGGT‑AATAAAGTCATATC‑AATTAAAGGGTGGTGAATCCGGGAGGAtccctagccttgtg > 2:262122/1‑287 (MQ=255) aTCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGc < 1:11732/300‑1 (MQ=255) tCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTNAGCTACGGACGCATCGAAAAATCTCCTTACCCTGCCGATCCC‑‑AA‑TACAAAT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAGGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTAATCGCATTGCGGCt > 1:591054/1‑300 (MQ=18) gaTGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGTGCTGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCGTCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGTGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTc < 2:179530/300‑1 (MQ=255) gACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCggg < 1:790811/300‑1 (MQ=255) tCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATACC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCg > 1:34677/1‑300 (MQ=255) aCGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTTGCCCTTCGGGCCGTTGCTa > 1:316822/1‑300 (MQ=255) gTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTaaa < 1:749490/300‑1 (MQ=255) 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cTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACNGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTNCTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGGTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGaaagtacgtagaat > 2:679476/1‑288 (MQ=14) ttGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATgg < 2:516984/300‑1 (MQ=255) tGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GA‑TACCGCT‑ACTAAAGCCATATC‑AATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGt < 1:725345/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |