| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 4,349,151 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑407/+160) | dcuB ← / ← dcuR | anaerobic C4‑dicarboxylate transporter DcuB/DNA‑binding transcriptional activator DcuR |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 4349151 = | 0 (0.000) | 131 (1.220) | 80/598 | 0.1 | 100% | intergenic (‑407/+164) | dcuB/dcuR | anaerobic C4‑dicarboxylate transporter DcuB/DNA‑binding transcriptional activator DcuR |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 4349155 | 0 (0.000) | 125 (1.180) | 86/594 | 0.0 | 100% | intergenic (‑411/+160) | dcuB/dcuR | anaerobic C4‑dicarboxylate transporter DcuB/DNA‑binding transcriptional activator DcuR |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GGCTTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTGGCACAAGTTTTACTGATGAAGGATGTAACTTGTGCCAGGGGTATTTTGCATTACGGTAATAATTATTACTTACAGATAACCAGCGATCCGTTATTGGCAATATTGTTTCAGTAGTGAGTAGTGTTCTGCCTGAATACGGTAACGGTAAACTGGACGCCCCGTGACGCCATAATGGATACTGGTGAACAAGATGTGGCAGTTGACCAGCCAGATGAGGTATTTACGGC > NC_000913/4348858‑4349451 | cgccagttcgcccggatgttgggacttgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccngagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgnaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGAAATTa < 2:774482‑M1/7‑1 (MQ=255) 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GGCTTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTGGCACAAGTTTTACTGATGAAGGATGTAACTTGTGCCAGGGGTATTTTGCATTACGGTAATAATTATTACTTACAGATAACCAGCGATCCGTTATTGGCAATATTGTTTCAGTAGTGAGTAGTGTTCTGCCTGAATACGGTAACGGTAAACTGGACGCCCCGTGACGCCATAATGGATACTGGTGAACAAGATGTGGCAGTTGACCAGCCAGATGAGGTATTTACGGC > NC_000913/4348858‑4349451 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |